Розблокування транскриптомів двох канцерогенних паразитів, Clonorchis sinensis та Opisthorchis

Афілійований відділ ветеринарних наук, Університет Мельбурна, Веррібі, Вікторія, Австралія

Афілійований відділ паразитології медичного факультету Університету Хон Каен, Хон Каен, Таїланд

Афілійований відділ паразитології та Інститут наук про здоров'я, Медичний факультет, Національний університет Кьонсан, Джинджу, Республіка Корея

Партнерський відділ патології медичного факультету Університету Хон Каен, Хон Каен, Таїланд

Affiliation Queensland Tropical Health Alliance, Університет Джеймса Кука, Смітфілд, Кернс, Квінсленд, Австралія

Афілійований відділ мікробіології, імунології та тропічної медицини Медичного центру університету Джорджа Вашингтона, Вашингтон, округ Колумбія, Сполучені Штати Америки

Афілійований відділ ветеринарних наук, Університет Мельбурна, Веррібі, Вікторія, Австралія

Ніл Д. Янг,
Бронвін Е. Кемпбелл,
Росс С. Холл,
Аарон Р. Джекс,
Cinzia Cantacessi,
Теварач Лаха,
Вун-Мок Сон,
Банчоб Шріпа,
Алекс Лукас,
Пол Дж. Бріндлі

Цифри

Анотація

Підсумок автора

Паразитичні черв’яки, Clonorchis sinensis та Opisthorchis viverrini, мають серйозний вплив на здоров’я десятків мільйонів людей по всій Азії. Однак найбільший вплив має злоякісний, не піддається лікуванню рак (холангіокарцинома), який ці паразити викликають у хронічно інфікованих людей. Ці печінкові птахи офіційно класифіковані Всесвітньою організацією охорони здоров’я (ВООЗ) як канцерогени 1 групи. Незважаючи на їх масовий вплив на здоров'я людини, про цих паразитів та їх взаємозв'язок з господарем на молекулярному рівні відомо мало. Тут ми даємо перше детальне уявлення про транскриптоми цих птахів, забезпечуючи міцну основу для всіх молекулярних/-омічних робіт, необхідних для розуміння їх біології, але, що більш важливо, для з’ясування ключових аспектів індукції холангіокарциноми. Хоча ми зосереджувались на паразитах, їх наслідки сягатимуть далеко за межі вивчення паразитарних хвороб. Важливо, що розуміння патогенезу інфекції, ймовірно, матиме серйозні наслідки для вивчення та розуміння інших видів раку.

Цитування: Young ND, Campbell BE, Hall RS, Jex AR, Cantacessi C, Laha T, et al. (2010) Розблокування транскриптомів двох канцерогенних паразитів, Clonorchis sinensis та Opisthorchis viverrini. PLoS Negl Trop Dis 4 (6): e719. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0000719

Редактор: Малкольм К. Джонс, Університет Квінсленда, Австралія

Отримано: 18 лютого 2010 р .; Прийнято: 28 квітня 2010 р .; Опубліковано: 22 червня 2010 р

Фінансування: З вдячністю відзначаємо фінансування Австралійської дослідницької ради (RBG). NDY був вдячним лауреатом премії Endeavour від уряду Австралії. Фінансисти не мали жодної ролі у розробці досліджень, зборі та аналізі даних, прийнятті рішення про публікацію чи підготовці рукопису.

Конкуруючі інтереси: Автори заявили, що не існує конкуруючих інтересів.

Вступ

Печінкові кишки (Platyhelminthes: Digenea) включають важливі еукаріотичні патогени людини, що переносяться їжею [1] - [5]. Наприклад, печінкові кишки Clonorchis sinensis та Opisthorchis viverrini, які спричиняють захворювання клонорхоз та опісторхоз, відповідно, представляють значну проблему охорони здоров’я у багатьох районах Азії [2], [3], [6]. Clonorchis sinensis є ендеміком переважно в регіонах Китаю (включаючи Гонконг та Тайвань), Кореї та Північного В'єтнаму [2], [6], тоді як O. viverrini ендемічний у всьому Таїланді, Лаоській Народно-Демократичній Республіці, В'єтнамі та Камбоджі [7] . Обидва ці паразити завдають величезних страждань десяткам мільйонів людей, і понад 600 мільйонів людей, за оцінками, мають ризик зараження [2], [8]. Незважаючи на зусилля по боротьбі з цими двома печінковими грибами, поширеність інфекції може досягати 70% у деяких регіонах, включаючи провінцію Гуансі в Китаї (C. sinensis) та провінцію Хон Каен у Таїланді (O. viverrini) [2], [7]. Пов'язаний з ним грип, O. felineus, є ендеміком у Сибіру та східних регіонах колишнього СРСР і викликає подібне захворювання та тягар хвороб, пов’язаних з O. viverrini та C. sinensis [4].

У людини початок холангіокарциноми трапляється із хронічним клонорхозом або опісторхозом, пов’язаним із ураженням гепатобіліарної системи, запаленням, перидуктальним фіброзом та/або клітинною реакцією на антигени від заражаючого птаха [24]. Ці умови схильні до холангіокарциноми, можливо, через посилену сприйнятливість ДНК до пошкодження канцерогенами [19], [20], [25] - [27]. Повідомляється, що хронічне пошкодження гепатобіліарної системи є багатофакторним і вважається, що воно виникає внаслідок тривалого механічного подразнення епітелію наявними птахами, особливо через їхні відсмоктувачі, метаболіти та виведені/секретовані антигени [28], [29], а також імунопатологічні процеси [21]. У регіонах, де О. viverrini є дуже ендемічним, захворюваність на холангіокарциному є безпрецедентною [3], [30]. Наприклад, холангіокарциноми становлять 15% первинного раку печінки у всьому світі, але в районі Хон Каен Таїланду цей показник переростає до 90%, що є найвищою зафіксованою захворюваністю на цей рак у світі [31].

На сьогоднішній день більшість молекулярно-біологічних досліджень соціально-економічно важливих трематод були зосереджені на кровотоках людини, Schistosoma mansoni та S. japonicum, нещодавно завершившись визначенням їх послідовностей ядерного геному [35], [36]. Ці геномні набори даних надають безцінний ресурс для підтримки вивчення фундаментальної біології та еволюції пташок, а також їх взаємодії між господарем та паразитами [36]. Однак біологія шистосом, які живуть дорослими дводомними дорослими в потоці крові господарів ссавців, значно відрізняється від біології гермафродитних печінкових сипків, таких як C. sinensis та O. viverrini. В даний час загалом лише available8000 виражених тегів послідовностей (EST) є загальнодоступними для C. sinensis [37] - [39] та O. viverrini [40], набору даних, занадто малого, щоб дати достатню інформацію про транскриптоми з цією метою. підтримки геномних та інших фундаментальних молекулярних досліджень.