Молекулярна реконструкція дієти у зразках людського стільця

Френк Мейкснер

a Eurac Research - Інститут досліджень муміє, Больцано, Італія

дієти

АНОТАЦІЯ

Розуміння дієтичного впливу на мікробний склад кишечника є одним із ключових питань у дослідженні мікробіомів людини. Дуже важливо мати достовірні дієтичні дані про зразки стільця, щоб однозначно пов’язати склад мікробіомів із споживанням їжі. Однак часто опитування дієти, про яке особисто повідомляють, має низьку точність і може ввести в оману. Таким чином, додаткові методи, засновані на молекулярній біології, можуть допомогти переглянути склад дієти. Стаття Reese et al. [А. T. Reese, TR Kartzinel, BL Petrone, PJ Turnbaugh, et al., MSystems 4 (5): e00458-19, 2019, https://doi.org/10.1128/mSystems.00458-19] у недавньому випуску mSystems описує стратегію метабаркодування ДНК, націлену на маркери ДНК хлоропластів у зразках калу від 11 осіб, які споживають як контрольовані, так і вільно підібрані дієти. Метою цього дослідження було оцінити ефективність цього молекулярного методу у виявленні рослинних решток у зразку порівняно з письмовими записами про дієту. Це дослідження показує важливий перший крок у впровадженні молекулярних дієтичних реконструкцій у дослідженнях мікробіомів стільця, що врешті допоможе підвищити точність дієтичних метаданих.

КОМЕНТАР

Дієта є важливим зовнішнім фактором, що впливає на склад мікробіому кишечника людини. Різні дослідження показали вплив змін дієти на мікроби кишечника, які згодом можуть вплинути на фізіологію людини (1). Експериментальна установка цих досліджень часто включала суттєві зміни в окремих макроелементах (наприклад, дієта з високим вмістом клітковини) (2). Однак, оскільки макроелементи рідко вживаються окремо, ці дослідження мікробіомів кишечника людини повинні, крім того, покладатися на опитування дієти людини, про які повідомляється самостійно. Це вводить у дію людські помилки, що призводить до неточних обстежень дієти через упередження, пов’язані з людською пам’яттю (3). Тому було б надзвичайно важливим включити до майбутніх досліджень дієти-мікробіому подальші молекулярні методи, що дозволяють проводити незалежну дієтичну реконструкцію аналізованих зразків стільця.