Безкоштовні повнотекстові новини про метаболізм вітаміну К у підошві Сенегалу (Solea senegalensis)
Максимальна вірогідність філогенетичного дерева епоксидредуктаз вітаміну К (Vkors). Еволюційна історія була зроблена за допомогою методу максимальної правдоподібності та моделі Ле і Гаскуеля [47]. Відсоток дерев, у яких пов'язані таксони згруповані між собою, показано поруч із гілками. Початкові дерева (дерева) для евристичного пошуку були отримані шляхом застосування методу Приєднання сусідів до матриці попарних відстаней, оцінених за допомогою моделі Джонса-Тейлора-Торнтона (JTT). Дискретний розподіл гамма використовувався для моделювання різниці еволюційних показників між сайтами (5 категорій (+ G, параметр = 0,7756)). Дерево намальовано в масштабі, довжина гілок вимірюється в кількості заміщень на ділянці. Цей аналіз включав 54 послідовності амінокислот. Були ліквідовані всі позиції з покриттям сайту менше 95%, тобто на будь-якій позиції дозволено менше 5% пробілів у вирівнюванні, відсутні дані та неоднозначні бази (опція часткового видалення). В кінцевому наборі даних було загалом 150 позицій. Еволюційні аналізи проводились у MEGA X [48]. Послідовність Ciona intestinalis Vkor була використана як допоміжна група для вкорінення дерева. Смужка шкали відображає кількість замін на сайт.