Генетичні детермінанти придатності in vivo до придатності та реагування на дієту у багатьох бактеріоїдах кишечника людини

Переглянути всі Сховати авторів та приналежності

Знайдіть цього автора на Google Scholar
Знайдіть цього автора на PubMed
Шукайте цього автора на цьому сайті
Для листування: [email protected]

Ви зараз переглядаєте реферат.

Увійдіть, щоб переглянути повний текст

Логін AAAS забезпечує доступ до Science для членів AAAS, а також доступ до інших журналів сімейства Science для користувачів, які придбали індивідуальні підписки.

Як послуга громаді, ця стаття доступна безкоштовно. Існуючі користувачі входять.

Увійдіть через свою установу

Більше варіантів

Завантажте та роздрукуйте цю статтю для власного наукового, дослідницького та навчального використання.

Придбайте єдиний випуск Science всього за 15 доларів США.

Дієта формує хазяїна та кишечника мікроби

Мікробіота кишечника людини надзвичайно різноманітна, багато варіантів штаму мають безліч ефектів на метаболізм та імунітет господаря. Щоб визначити деякі з цих функцій, Wu et al. зробив бібліотеки мутантів видів Bacteroides, відомих своєю здатністю переробляти невідступні харчові волокна. Безмікробних мишей, колонізованих із визначеними спільнотами мікробіоти кишечника, що містять мутанти, годували певними дієтами, що містять різні співвідношення жиру та клітковини. Були визначені гени, штами та види, які були пов'язані з конкретними метаболічними шляхами. Реакції громади на зміни дієти маніпулювали, намагаючись охарактеризувати види за їх пробіотичним або терапевтичним потенціалом.

Структурований реферат

ВСТУП

Порівняно мало відомо про генетичні фактори, що дозволяють представникам мікробіоти кишечника людини зайняти свої ніші. Визначення цих факторів є важливим для розуміння механізмів, що визначають збір та збурення мікробіоти за допомогою дієти, хвороб та клінічного лікування. Виявлення цих факторів має дати можливість нових підходів до терапевтичного втручання у функціональні властивості мікробіоти кишечника людини. Ми представляємо узагальнений підхід, за допомогою якого ідентифікуємо детермінанти придатності для кількох штамів бактерій одночасно в модельній мікробіоти кишечника людини, отримуємо характеристику реакцій на зміну раціону на генному рівні та розробляємо пребіотики для точної маніпуляції мікробіоти.

ОБГОВОРЕННЯ

РЕЗУЛЬТАТИ

Multi-таксон INSeq (i) забезпечив цифровим зчитуванням надзвичайно послідовного шаблону збору громади; (іі) визначені спільні, а також видові, штамові та дієтичні детермінанти придатності, пов’язані з різноманітними шляхами обміну речовин або поживних речовин, включаючи такі, що включають амінокислоти, вуглеводи та вітаміни/кофактори; (iii) дозволило кількісно виміряти рівень стійкості реакцій на збурення дієти на рівні генів; (iv) виявив, що арабіноксилан, найпоширеніша геміцелюлоза в злаках, може бути використаний для навмисного маніпулювання представництвом Bacteroides cellulosilyticus; та (v) визначив коригування ніш цього та інших Бактероїдів до добавки арабіноксилану до дієти з високим вмістом жиру.