Генетичні варіанти FTO та ризик ожиріння та діабету 2 типу Мета-аналіз 28 394 індіанців -
Відділ молекулярної медицини та хірургії Дослідницький центр діабету та ендокринології Рольфа Луфта, Інститут Каролінської, Стокгольм, Швеція

Кафедра ендокринології діабету та метаболізму, Крістіанський медичний коледж, Веллоре, Тамілнад, Індія
Оксфордський центр ендокринології діабету, діабету та метаболізму, Оксфорд, Великобританія
НІПЛ Оксфордський центр біомедичних досліджень, ORH Trust, Оксфорд, Великобританія
Відділ молекулярної медицини та хірургії Дослідницький центр діабету та ендокринології Рольфа Луфта, Інститут Каролінської, Стокгольм, Швеція
Відділ молекулярної медицини та хірургії Дослідницький центр діабету та ендокринології Рольфа Луфта, Інститут Каролінської, Стокгольм, Швеція
Відділ епідеміології MRC, Саутгемптон, Великобританія
Кафедра медичних наук, молекулярна епідеміологія, Університет Уппсали та лабораторія Science for Life, Упсала, Швеція
Кафедра медичних наук, молекулярна епідеміологія, Університет Уппсали та лабораторія Science for Life, Упсала, Швеція
Відділ молекулярної медицини та хірургії Рольф Люфт Дослідницький центр діабету та ендокринології, Інститут Каролінської, Стокгольм, Швеція
Кафедра ендокринології діабету та метаболізму, Крістіанський медичний коледж, Веллоре, Тамілнад, Індія
Оксфордський центр ендокринології діабету, діабету та метаболізму, Оксфорд, Великобританія
NIHR Oxford Biomedical Research Center, ORH Trust, Оксфорд, Великобританія
Відділ молекулярної медицини та хірургії Дослідницький центр діабету та ендокринології Рольфа Луфта, Інститут Каролінської, Стокгольм, Швеція
Відділ молекулярної медицини та хірургії Дослідницький центр діабету та ендокринології Рольфа Луфта, Інститут Каролінської, Стокгольм, Швеція
Відділ епідеміології MRC, Саутгемптон, Великобританія
Кафедра медичних наук з молекулярної епідеміології Університету Уппсали та лабораторії Science for Life, Упсала, Швеція
Кафедра медичних наук, молекулярна епідеміологія, Університет Уппсали та лабораторія Science for Life, Упсала, Швеція
Бюджетні агентства: SKV підтримується Фондом сім'ї Ерлінґ-Перссона. ФТ підтримується за рахунок коштів Сьомої рамкової програми Європейського Співтовариства (FP7/2007–2013), консорціуму ENGAGE, грантової угоди HEALTH ‐ F4–2007‐ 201413.
Розкриття інформації: Автори не заявили про конфлікт інтересів.
Внески автора: SKV, TF та FK задумали дослідження. SKV та TF провели аналіз. Усі автори брали участь у написанні статті та мали остаточне схвалення поданих та опублікованих версій.
Анотація
Об’єктивна
Дослідити величину асоціації FTO варіанти з ожирінням, діабетом 2 типу (T2DM) та суміжними ознаками серед азіатських індіанців.
Методи
Метааналіз випадкового ефекту був проведений на об'єднаних даних восьми досліджень ( = 28394) для ожиріння та пов'язаних з ним ознак та шість досліджень ( = 24,987) для оцінки ризику T2DM у індіанців, де повідомлялося про варіанти FTO.
Результати
Неповнолітній алель A FTO варіант rs9939609 асоціювався з підвищеним ризиком ожиріння (АБО 1,15, 95% ДІ 1,08–1,21, стор = 2,14 × 10 - 5), ІМТ (β = 0,30 кг/м 2, 95% ДІ 0,21–0,38, стор = 4,78 × 10 - 11) та інші регіональні вимірювання ожиріння [талія (β = 0,74 см, 95% ДІ 0,49-0,99), HC (β = 0,52, 95% ДІ 0,26–0,78) і співвідношення талія-стегна (WHR) (β = 0,002, 95% ДІ 0,001–0,004)] в індіанців (стор ≤ 0,001). Підвищений ризик розвитку СД2 (АБО 1,11; 95% ДІ 1,04–1,19, стор = 0,002), яке зменшувалось при поправці на вік, стать та ІМТ (АБО 1,09; 95% ДІ 1,02–1,16, стор = 0,01).
Висновки
Наше дослідження пропонує докази зв’язку між загальним FTO варіант і ризик ожиріння серед індіанців із порівнянними розмірами ефекту, як у кавказців. Затухання FTOРизик ‐T2DM внаслідок коригування ІМТ підкріплює те, що ІМТ не повністю враховує наслідки ожиріння серед азіатських індіанців, які страждають на більш центральне ожиріння.
Вступ
Методи
Пошук літератури
Варіанти в комплекті
Найчастіше аналізований варіант rs9939609 був основним SNP, що цікавить поточний мета-аналіз. Дослідження, які повідомляли про асоціації з іншими варіантами (проксі SNP), перевіряли на нерівновагу зв’язку (LD) за допомогою панелі GIH (індіанці гуаджараті в Х'юстоні), дані HapMap (http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/). У семи дослідженнях повідомлялося про асоціації rs9939609, а в одному дослідженні - проксі (rs3751812), який має високий рівень LD з індексом SNP (р 2 = 0,97) (13). Рівень успішності генотипування становив> 95% у всіх дослідженнях. Розподіл генотипів був у рівновазі Харді-Вайнберга в цілому, але для одного дослідження (14), ймовірно, через високе споріднене походження, як повідомляють автори.
Ожиріння та антропометричні вимірювання
Цукровий діабет 2 типу
Діагноз T2DM був перевірений у всіх дослідженнях та відповідав одному або декільком з наступних критеріїв: (i) глюкоза натще ≥7,0 ммоль/л; (ii) 2-годинна глюкоза після їжі ≥11,1 ммоль/л; (iii) HbA1C ≥ 6,5%; (iv) попередній діагноз T2DM або лікування T2DM; та (v) T2DM, про який повідомляється самостійно.
Мета-аналіз
Результати
Остаточний набір даних включав корінних індіанців (шість досліджень, = 15 785) та індіанців-мігрантів (два дослідження на основі популяції, = 12 609) у Сінгапурі (SINDI) (23, 29) та Великобританії (LOLIPOP) (19). Три з 6 досліджень серед індіанців включали контроль випадків захворювання на Т2DM, тоді як 3 були засновані на популяції, 1 з яких включав 3390 пар сіб. Детальні характеристики окремих досліджень та учасників зведені в таблицю 1. Середній вік загальної чисельності населення коливався від 28 до 59 років (корінні індіанці: 28–52 роки; індіанці-мігранти: 48–58 років), а ІМТ - від 21 до 27 років. кг/м 2 (корінні індіанці: 21,0–26,3 кг/м 2; індіанці-мігранти: 26,8–27,1 кг/м 2). MAF коливався від 0,30 до 0,35 для rs9939609 і становив 0,34 для проксі-сервера SNP (rs3751812). Ми підрахували вибірку з 4813 осіб для отримання 80% енергії (Довідкова інформація, таблиця 1). Лише два дослідження показали адекватну силу в індивідуальному порядку. Одне дослідження послідовно залишалося невідомим (7) і повідомляло набагато більший розмір ефекту, ніж інші. Однак це дослідження включало менший обсяг вибірки та лише зробило приблизно 6% від загальної ваги мета-аналізу.
| Сангера ДК | Дослідження діабету сикхів [7] | 2008 рік | Індія | Північна Індія | контроль справи | RS9939609 | 0,30 | 386 | 765 | 184/202 | 50,9 | 26.3 | 532 | 299/233 | 54.2 | 27.8 | |
| Яжник К.С. | Парфенон [8] | 2009 рік | Індія | Північна Індія | контроль справи | RS9939609 | 0,31 | 961 | 967 | 446/515 | 32.4 | 23.8 | - | - | - | - | |
| Яжник К.С. | PPMNS [8] | 2009 рік | Індія | Південна Індія | контроль справи | RS9939609 | 0,31 | 1361 | 1876 рік | 729/632 | 34,5 | 21.4 | - | - | - | - | |
| Яжник К.С. | ВЕЛЬГЕН [8] | 2010 рік | Індія | Південна Індія | контроль справи | RS9939610 | - | - | - | - | - | - | 1453 рік | 818/635 | 46.6 | 26.3 | |
| Chauhan G Stg 1 | Північно-Індійський етап 1 [9] | 2011 рік | Індія | Північна Індія | контроль справи | RS9939609 | 0,38 | 1006 | 998 | 606/400 | 50 | 24.1 | 1019 | 592/427 | 53 | 25.3 | |
| Chauhan G Stg 2 | Північна Індія Sstage 2 [9] | 2011 рік | Індія | Північна Індія | контроль справи | RS9939609 | 0,25 | 1848 рік | 1628 рік | 1017/831 | 52 | 25.5 | 1401 | 851/550 | 55 | 26.4 | |
| Тейлор А.Е. | Дослідження міграції в Індії [12] | 2011 рік | Індія | Змішані | Населення | RS9939609 | 0,33 | 6942 | 6780 | 3925/2855 | 40,7 | 23.8 | - | - | - | - | |
| Мур КС | Індійське дослідження здоров’я [13] | 2011 рік | Індія | Змішані | Населення | RS3751812 | 0,34 | 1129 | 1129 | 510/609 | 48 | 23.8 | - | - | - | - | |
| Васан С.К. | Когорта народжень Vellore [114] | 2012 рік | Індія | Південна Індія | Населення | RS9939609 | 0,3 | 2152 | 2060 рік | 1034/1118 | 28 | 20.7 | - | - | - | - | |
| Тан Дж | SINDI [23] | 2008 рік | Сінга-поре | Змішані | Населення | RS9939609 | 0,33 | 2531 | 1348 | 1290/1241 | 58.04 | 26.9 | - | - | - | - | |
| Палати J | ЛОЛІПОП IA317 [19] | 2008 рік | Великобританія | Змішані | Населення | RS9939609 | 0,32 | 2684 | 2247 | 2684/0 | 48.2 | 26.8 | - | - | - | - | |
| Палати J | ЛОЛІПОП IA610 [19] | 2008 рік | Великобританія | Змішані | Населення | RS9939609 | 0,33 | 7394 | 7060 | 4214/3180 | 55,38 | 27.1 | - | - | - | - | |