Навіть при стандартизованому харчуванні кишкова флора змінюється з дня на день
Дослідники лише починають розуміти, як мікробіом кишечника - життєво важливе співтовариство мікроорганізмів, що живе в нашому кишечнику - взаємодіє з нашим тілом і їжею, яку ми їмо. Для лікарів та науковців проблема полягає в тому, щоб передбачити, чи пов’язані зміни в мікробах кишечника з хворобою, дієтою чи обома - складна проблема, пов’язана з постійно мінливим характером кишкових бактерій, споживанням їжі та способами, якими ці два взаємодіяти.

Студенти Центру мікробіомної інформатики та терапії (CMIT) та програми "Науки про здоров'я та технології", дві ініціативи, засновані на MIT, прагнули виявити, як стабілізувати мікробіом кишечника та відокремити наслідки дієти та захворювань, що дозволить глибше вивчити зв’язок між кишечником та здоров’ям людини. Дослідження було нещодавно опубліковано в Наукові звіти і очолюваний Томасом Гаррі, вченим-дослідником CMIT, який отримав ступінь доктора філософії з обчислювальної та системної біології в MIT у 2015 році.
"Ряд досліджень показує зв'язок між складами мікробіомів кишечника та раціоном, але точні взаємозв'язки між окремими поживними речовинами та їх впливом на склад важко визначити", - говорить Гаррі. "Ми хотіли досягти більш високого рівня розв'язання, ніж дослідження в минулому".
Фіксовані дієти важко розробити та реалізувати, особливо для групи людей. Дотримання певного режиму вживання їжі має вирішальне значення, оскільки відсутність одного інгредієнта може змінити склад конкретного прийому їжі та вплинути на отриманий зразок стільця, роблячи результати непридатними.
Рідкі замінники їжі у формі коктейлів у пляшках зазвичай подають у лікарнях по всій країні. Їх часто дають як харчову добавку - а іноді і як виключне джерело харчування - пацієнтам, починаючи від людей похилого віку і закінчуючи лікуванням від розладів харчування. Маючи це на увазі, дослідники вирішили використовувати коктейльний рідкий шейк-замінник Ensure як єдине джерело їжі для фіксованого харчування своїх випробовуваних. Перевага рідкого коктейлю перед порціонованим прийомом їжі, розсудили дослідники, полягає в тому, що люди не можуть навмисно або випадково залишати будь-яку частину їжі.