Нецільові метаболомічні зміни сироватки у відповідь на дієтичне втручання у собак з доклінічними захворюваннями
Цінхун Лі
1 Nestlé Purina Research, Сент-Луїс, Міссурі, Сполучені Штати Америки
Дороті П. Лафламм
2 Консультант з наукових комунікацій, Флойд, штат Вірджинія, Сполучені Штати Америки
Джон Е. Бауер
3 Заслужений професор Техаського університету A&M, Лонгмонт, Колорадо, Сполучені Штати Америки
Пов’язані дані
Усі відповідні дані знаходяться в рукописі та в допоміжних файлах.
Анотація
Депривація енергії міокарда відіграє причинну роль у розвитку серцевої недостатності. Суміш для захисту серця (CPB) поживних речовин, включаючи тригліцериди середнього ланцюга, риб’ячий жир та інші ключові поживні речовини, була розроблена для уповільнення прогресування собачої міксоматозної хвороби мітрального клапана (MMVD). Шість місяців дієтичне втручання продемонструвало ефективність CPB для уповільнення прогресування MMVD. Нецільовий метаболічний аналіз сироватки крові цих собак виявив 102 диференціальних метаболіти (скоригований P g log 2 (x) = log 2 x + (a 2 + x 2) 2
де a - константа зі значенням за замовчуванням 1. Нарешті, трансформовані дані були автоматично масштабовані для досягнення нульового середнього значення та одиничної дисперсії для будь-якої змінної: zij = xij - xi ¯ si, де xij - значення i-го метаболіту і j-та вибірка, а xi ¯ та si - середнє та стандартне відхилення відповідно. Перевага автомасштабування полягає в тому, що всі метаболіти стають однаково важливими [31].
Статистичний аналіз
Аналіз основних компонентів (PCA) для багатовимірних багатовимірних даних проводили на базових та 6-місячних даних. Перші два основні компоненти (ПК), які фіксують більше варіацій даних, ніж інші ПК, були досліджені на предмет їх здатності розділяти групи на основі дієти (CON проти CPB) або часу (0 проти 6 місяців). Була проведена багаторазова лінійна регресія з використанням кожного ПК як залежною змінної, а дієти або часу як незалежної змінної, скоригованої для статі, віку, породи та оцінки стану тіла (BCS) та отримано значення Р для моделі. Дані за 6 місяців піддавали частковому дискримінантному аналізу найменших квадратів (PLS-DA), щоб виявити ключові метаболіти з найвищим значенням змінної важливості в проекції (VIP). Було здійснено пошук максимум п’яти компонентів для досягнення оптимальної продуктивності та проведено поодиноку перехресну перевірку для оцінки точності прогнозування моделі.
Для кожного метаболіту ефект дієти за часом взаємодії оцінювали за допомогою лінійної моделі змішаного ефекту, скоригованої для віку, породи, статі та BCS. Значення P для умов взаємодії були отримані та скориговані для багаторазового тестування для контролю швидкості помилкових виявлень (FDR) [32]. Метаболіт вважався значущим, якщо FDR становив менше 0,05. Зміна складки (FC) визначається як відношення 6 місяців (t6) до базового рівня (t0). Оскільки мінімальне значення вихідних даних набагато більше 1, FC ≈ 2 (t6 − t0), якщо t6 ≥ t0 або F C ≈ - 1 2 (t 6 - t 0), якщо t6 Рис. 1A та 1B). Значення р та ефекти коригування для статі, віку, породи та BCS від множинних моделей регресії були представлені у файлі S3. На перші два основні компоненти, PC1 та PC2, припадає 19,4% та 12,7% загальної зміни даних на початковому рівні та 20,5% та 14,1% через 6 місяців відповідно. PCA, проведений для оцінки змін у часі, не виявив змін у собак CON, але суттєвий ефект часу вздовж PC1 спостерігався у собак CPB ((P = 0,74, P = 3,4e-04 відповідно, S1 Рис.) Не було виявлено поділу вздовж PC2 (усі P> 0,05).
Таблиця 1
SM, сфінгомієлін; АА, амінокислота; СНО, вуглеводи; NT, нуклеотид; CF_Vit, кофактори та вітаміни; Ксено, ксенобіотик; FA, жирна кислота; FDR, коефіцієнт помилкового виявлення; FC, зміна складки; CON, контрольна дієта; CPB, суміш для захисту серця. KEGG, Кіотська енциклопедія генів і геномів; PUBCHEM, відкрита база даних хімії в NIH; HMDB, База даних метаболомів людини. Негативні складчасті зміни являють собою зниження концентрації від вихідного рівня до 6 місяців.
За допомогою PLS-DA було виявлено десять метаболітів з найвищими показниками VIP. Капрат, EPA, DHA та його похідне фосфатидилхоліну DHA-PC та X-13866, метаболіт з невідомою ідентичністю, були вищими у собак CPB, ніж у собак CON, тоді як два гліцерофосфатидилхоліни, один лізофосфоліпід, невідомий метаболіт X-11795 та один сфінгомієлін нижча у собак CPB (рис. 1D). Значення R2 та Q2, оцінки точності прогнозування моделі, були представлені у файлі S3.
Співвідношення Омега-6 до Омега-3 FA
Три собаки поліненасичених жирних кислот (PUFA), ейкозапентаеноат (EPA; 20: 5n-3), докозапентаеноат (DPA; 22: 5n-3) та докозагексаєноат (DHA; 22: 6n-3) були збільшені у собак CPB, але зменшився у собак CON. На відміну від них, три омега-6 ПНЖК, арахідонат (ARA, 20: 4n-6), адренат (22: 4n-6) і докозапентаеноат (n6 DPA; 22: 5n-6), і один омега-9 ПНЖК, медовуха кислоти (20: 3n-9), були зменшені порівняно з початковим рівнем у собак CPB, але зросли у собак CON (рис. 2А). На початку співвідношення сироватки омега-6 до омега-3 становило 2,41 для собак CON і 1,46 для собак CPB. Ці співвідношення змінилися відповідно до 4,30 та 0,46 через 6 місяців відповідно (рис. 2Б).
Складні зміни між дієтами CPB проти CON у (A) поліненасичених FA, (B) співвідношеннях омега-6 до омега-3 FA, (C) ацилкарнітинах та дезоксикарнітині, (D) прямий ланцюг, розгалужений ланцюг та дикарбонові FA, та (E) L-аргінін, L-цитрулін та 2-аміномасляна кислота (AABA) на початковому рівні (0) та 6 місяців (6). Червоні, зелені та золоті злитки вздовж осі х зображують (A) омега-3, -6 та -9 FA відповідно та (D) прямі, розгалужені ланцюги та дикарбонові FA відповідно. Негативна зміна складки являє собою зменшення від базового рівня до 6 місяців.