Порівняння геномів м’ясоїдних, всеїдних та рослиноїдних ссавців з новою леопардовою збіркою
Сунок Кім
1 Відділ оцінки біологічних та генетичних ресурсів, Національний інститут біологічних ресурсів, Інчхон, 22689 Республіка Корея
Юн Сон Чо
2 Інститут геноміки, Ульсанський національний інститут науки і техніки (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
3 Департамент біомедичної інженерії Школи наук про життя Ульсанського національного інституту науки і технологій (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
4 Інститут особистої геноміки, Фонд досліджень геному, Чхонджу, 28160, Республіка Корея
Хак-Мін Кім
2 Інститут геноміки, Ульсанський національний інститут науки і техніки (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
3 Департамент біомедичної інженерії Школи наук про життя Ульсанського національного інституту науки і технологій (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
Оксунг Чунг
4 Інститут особистої геноміки, Фонд досліджень геному, Чхонджу, 28160, Республіка Корея
Хюньо Кім
5 Geromics, Ульсан, 44919 Республіка Корея
Sungwoong Jho
4 Інститут особистої геноміки, Фонд досліджень геному, Чхонджу, 28160, Республіка Корея
Гонг Соомун
6 Відділ тваринних ресурсів, Національний інститут біологічних ресурсів, Інчхон, 22689 Республіка Корея
Чонхо Кім
7 зоопарк Чеонджу, Чхонджу, 28311 Республіка Корея
Ву Юнг Банг
1 Відділ оцінки біологічних та генетичних ресурсів, Національний інститут біологічних ресурсів, Інчхон, 22689 Республіка Корея
Чанму Кім
1 Відділ оцінки біологічних та генетичних ресурсів, Національний інститут біологічних ресурсів, Інчхон, 22689 Республіка Корея
Джунгва Ан
6 Відділ тваринних ресурсів, Національний інститут біологічних ресурсів, Інчхон, 22689 Республіка Корея
Чанг Хван Бае
1 Відділ оцінки біологічних та генетичних ресурсів, Національний інститут біологічних ресурсів, Інчхон, 22689 Республіка Корея
Янгджуне Бхак
2 Інститут геноміки, Ульсанський національний інститут науки і техніки (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
Сунвон Чон
2 Інститут геноміки, Ульсанський національний інститут науки і техніки (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
3 Департамент біомедичної інженерії Школи наук про життя Ульсанського національного інституту науки і технологій (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
Хьеджун Юн
2 Інститут геноміки, Ульсанський національний інститут науки і техніки (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
3 Департамент біомедичної інженерії Школи наук про життя Ульсанського національного інституту науки і технологій (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
Юмі Кім
2 Інститут геноміки, Ульсанський національний інститут науки і техніки (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
JeHoon черв
4 Інститут особистої геноміки, Фонд досліджень геному, Чхонджу, 28160, Республіка Корея
5 Geromics, Ульсан, 44919 Республіка Корея
ХеДжин Лі
4 Інститут особистої геноміки, Фонд досліджень геному, Чхонджу, 28160, Республіка Корея
5 Geromics, Ульсан, 44919 Республіка Корея
Суан Чо
4 Інститут особистої геноміки, Фонд досліджень геному, Чхонджу, 28160, Республіка Корея
5 Geromics, Ульсан, 44919 Республіка Корея
Ольга Уфиркіна
8 Інститут біології та ґрунтознавства Далекосхідного відділення Російської академії наук, Владивосток, 690022 Росія
Олексій Костиря
8 Інститут біології та ґрунтознавства Далекосхідного відділення Російської академії наук, Владивосток, 690022 Росія
Джон Гудріч
9 Пантера, Нью-Йорк, Нью-Йорк 10018 США
Дейл Мікель
10 Товариство охорони дикої природи, 2300 Південний бульвар, Бронкс, Нью-Йорк 10460 США
11 Кафедра екології, Далекосхідний федеральний університет, Айякс, острів Російський, Владивосток, 690950 Росія
Мелодія Ролке
12 Програма лабораторії наук про тварин, Leídos Biomedical Research Inc., Національна лабораторія Фредеріка, Фредерік, MD 21702 США
Джон Льюїс
13 Міжнародна ветеринарна група зоопарку (Великобританія) IZVG LLP, Station House, Parkwood Street, Keighley, BD21 4NQ UK
Андрій Юрченко
14 Центр біоінформатики геному Феодосія Добжанського, Санкт-Петербурзький державний університет, Санкт-Петербург, 199004 Росія
Антон Банкевич
15 Центр алгоритмічної біотехнології, Інститут поступальної біомедицини, Санкт-Петербурзький державний університет, Санкт-Петербург, 199034 Росія
Жуок Чо
16 Широкий інститут Массачусетського технологічного університету та Гарварду, Кембридж, Массачусетс 02142 США
Семін Лі
2 Інститут геноміки, Ульсанський національний інститут науки і техніки (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
3 Департамент біомедичної інженерії Школи наук про життя Ульсанського національного інституту науки і технологій (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
17 Департамент біомедичної інформатики Гарвардської медичної школи, Бостон, Массачусетс 02115 США
Джеремі С. Едвардс
18 Хімія та хімічна біологія, Комплексний онкологічний центр ООН, Університет Нью-Мексико, Альбукерке, штат Нью-Йорк 87131 США
Джессіка А. Вебер
19 Біологічний факультет Університету Нью-Мексико, Альбукерке, штат Нью-Мексико 87131 США
Джо Кук
20 Зоологічне товариство Лондона, Лондон, NW1 4RY Великобританія
Сангсу Кім
21 Кафедра біоінформатики та біологічних наук, Університет Сунсіл, Сеул, 06978 Республіка Корея
Повісити Лі
22 Банк ресурсів збереження геному корейської дикої природи, Коледж ветеринарної медицини, Сеульський національний університет, Сеул, 08826 Республіка Корея
Андреа Маніка
23 Кафедра зоології Кембриджського університету, Даунінг-стріт, Кембридж, CB2 3EJ, Великобританія
Ільбеум Лі
24 Daejeon O-World, Daejeon, 35073 Республіка Корея
Стівен Дж. О’Брайен
14 Центр біоінформатики геному Феодосія Добжанського, Санкт-Петербурзький державний університет, Санкт-Петербург, 199004 Росія
25 Океанографічний центр 8000 N. Ocean Drive, Південно-Східний університет Нова, Форт-Лодердейл, FL 33004 США
Джон Бхак
2 Інститут геноміки, Ульсанський національний інститут науки і техніки (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
3 Департамент біомедичної інженерії Школи наук про життя Ульсанського національного інституту науки і технологій (UNIST), Ульсан, 44919 Республіка Корея
4 Інститут особистої геноміки, Фонд досліджень геному, Чхонджу, 28160, Республіка Корея
5 Geromics, Ульсан, 44919 Республіка Корея
Джо-Хон Йе
1 Відділ оцінки біологічних та генетичних ресурсів, Національний інститут біологічних ресурсів, Інчхон, 22689 Республіка Корея
Пов’язані дані
Проект цілого геномного дробовика з леопардом був депонований у DDBJ/EMBL/GenBank під вступом> LQGZ00000000. У цьому документі описана версія> LQGZ01000000. Зчитування послідовності необроблених ДНК подано в базу даних NCBI Sequence Read Archive (SRA321193). Усі дані, використані в цьому дослідженні, також доступні на ftp://biodisk.org/Distribute/Leopard/.
Анотація
Передумови
У ссавців є три основні дієтичні групи: м’ясоїдні, всеїдні та рослиноїдні. В даний час існує обмежений порівняльний аналіз геноміки щодо еволюції дієтичної спеціалізації у ссавців. Завдяки недавнім досягненням технологій секвенування, нам вдалося провести поглиблений аналіз цілого геному представників цих трьох дієтичних груп.