Повнотекстова гомологічна рекомбінація без бродіння Інструмент редагування геному дріжджів GRAS HTML

Годинник 1890 року. (A) Вид спереду та (B) хитромудра внутрішня робота шестірні механічного годинника в поєднанні з музичним годинником.

інструмент

(A) Порівняння гомологічної рекомбінації (HR) та негомологічного кінцевого з'єднання (NHEJ). З нагоди розриву дволанцюжкової ДНК існує два можливі механізми відновлення. HR (ліва панель) вимагає створення шаблону, займає кілька годин, але є надзвичайно точним і порівнянним із комп’ютерною командою “скопіювати + вставити”. NHEJ (права панель) не вимагає шаблону, схильний до помилок, але швидший і може бути пов'язаний з мотузковим вузлом. (B) Схематичний огляд механізмів HR (ліворуч) та NHEJ (праворуч). HR: після резекції ланцюгів ДНК екзонуклеазою, Rad51 та інші білки утворюють нуклеопротеїновий комплекс, який шукає і вторжується в шаблонну ланцюг, утворюючи D-петлю. Петля переміщення може бути вирішена шляхом синтезозалежного відпалу нитки (внизу ліворуч), що не призводить до перехрещення. Ремонт подвійного ланцюга може вирішити святкові сполучення або кросовером (показано), або не кросовером. NHEJ: димер білка Ku70/Ku80 захищає кінці ДНК від деградації/резекції та вербує, наприклад, ДНК-залежну каталітичну субодиницю протеїнкінази (DNA-PK). Сестринські хроматиди представлені двома стрілками відповідно червоним і синім кольорами. Світлий і темний кольори розрізняють нитки ДНК. Стрілки вказують на 5′-3 ′ орієнтацію ланцюгів ДНК, а штрихові лінії представляють новосинтезовану ДНК.

Перемикач типу спарювання у Saccharomyces cerevisiae. (А) Тип клітини у S. cerevisiae визначається локусом MAT. У клітинах є алель у локусі MAT, тоді як α клітини мають MAT α. Локус MAT знаходиться на CHRIII. На теломерних кінцях цієї хромосоми є мовчазні касети обох типів спарювання, HML α ліворуч і HMR a праворуч. (B) Переключення типу спарювання ініціюється ендонуклеазою Ho, яка розщеплюється на певній ділянці на межі області Y-Z, утворюючи дволанцюгову розрив (DSB). Це ініціює конверсію генів, використовуючи, з високою точністю, протилежну тиху касету типу спаровування як шаблон для відновлення DSB, що призводить до перемикання типу спарювання [51].