Розподіл мікробіоти по різних сегментах кишкового тракту багатожильного карликового мінка

Ключова лабораторія біології збереження для зникаючих морських ссавців, Науково-дослідний інститут океану Ляонін та рибальство, Далянь, Китай

Внесок: Концептуалізація, Формальний аналіз, Залучення фінансування, Методологія, Написання - оригінальний проект

Листування

Цзін Ду, ключова лабораторія біології збереження морських ссавців, що знаходиться під загрозою зникнення, Науково-дослідний інститут океану та рибальства Ляонін, 50 Heishijiao Road, район Шахекоу, Далянь, Ляонін, Китай.

Внесок: Концептуалізація, курація даних, збір коштів, розслідування, методологія, написання - оригінальний проект

Внесок: Формальний аналіз, програмне забезпечення, написання - огляд та редагування

Внесок: Концептуалізація, ресурси, нагляд, написання - огляд та редагування

Внесок: Дослідження, Методологія, Написання - оригінальний проект

Центр обслуговування сучасного розвитку сільськогосподарського виробництва Далянь, Далянь, Китай

Внесок: Формальний аналіз, адміністрування проекту

Даляньська ключова лабораторія біології збереження зникаючих морських ссавців, Науково-дослідний інститут океану Ляонін та рибальство, Далянь, Китай

Внесок: Формальний аналіз, адміністрування проекту

Листування

Внесок: Формальний аналіз, програмне забезпечення, написання - огляд та редагування

Внесок: Концептуалізація, ресурси, нагляд, написання - огляд та редагування

Внесок: Дослідження, Методологія, Написання - оригінальний проект

Центр обслуговування сучасного розвитку сільськогосподарського виробництва Далянь, Далянь, Китай

Внесок: Формальний аналіз, адміністрування проекту

Анотація

Морські ссавці є важливою частиною океанічних екосистем, кити відіграють життєво важливу роль у морському харчовому ланцюзі. У цьому дослідженні слизова оболонка та вміст різних сегментів кишкового тракту (МТС) багатожильного карликового кита (Balaenoptera acutorostrata) були проаналізовані. Мікробіоти кишечника секвенували за допомогою високопродуктивної технології секвенування на основі підходу 16S рРНК. Мікробний склад слизової оболонки кишечника та його вміст були однаковими в кожному ІТС. Багатство та різноманітність мікробіоти товстої кишки було значно вищим у порівнянні з дванадцятипалою кишкою та тонкою кишкою. Домінуючими бактеріями в кишечнику були Фірма і Актинобактерії; перший збагачувався у товстій кишці, тоді як другий містив більше в дванадцятипалій кишці та тонкій кишці. Наші висновки дають нові уявлення про мікробіоти в Росії B. acutorostrata.

1. ВСТУП

Шлунково-кишкові тракти тварин - це складні мікроекосистеми, що складаються з клітин хазяїна та мікробіоти кишечника (Backhed, 2005). Їх симбіотичні стосунки впливають не тільки на обмін речовин, вироблення енергії, ріст та імунітет, але також лежать в основі ряду патологічних станів (Flint, Scott, Louis, & Duncan, 2012; Malmuthuge, Li, Goonewardene, Oba, & Guan, 2013). Морські ссавці є важливими мікробними резервуарами завдяки постійній температурі тіла та великим розмірам (Higgins, 2000), а останніми роками з'ясовано коменсальну мікробіоти різних морських ссавців (Chiarello, Villéger, Bouvier, Auguet, & Bouvier, 2017; Numberger, Herlemann, Jürgens, Dehnhardt, & Schulz ‐ Vogt, 2016). Моніторинг мікробіоти кишечника морських ссавців може допомогти розкрити пристосувальні механізми до різних дієт або середовищ існування. Наприклад, метагеномічне дослідження повідомило про високий потенціал транспорту поживних речовин та циклічного потенціалу в мікробіоти кишечника австралійського морського лева, Neophoca cinerea (Lavery, Roudnew, Seymour, Mitchell, & Jeffries, 2012). Більше того, мікробіота кишок китів та наземних травоїдних тварин виявляє подібний ферментативний метаболізм, тоді як шляхи катаболічного білка та синтезу амінокислот у кишечнику кита дуже нагадують наземних хижих тварин (Sanders et al., 2015).

Карликовий мінк-кит, Balaenoptera acutorostrata, є найпоширенішим видом вусатого кита і широко поширений у північній частині Атлантики та північній частині Тихого океану (Walquist, Stormo, Jensen, Bjarne, & Eilertsen, 2017). Це корми на рибі, такі як мойва, оселедець, скумбрія та тріска, а також ракоподібні, такі як криль (Jonsgård, 1982; Windsland, Lindstrom, Nilssen, & Haug, 2007), припускаючи, що мікробіота кишечника кита адаптується до різноманітної їжі джерел. Завдяки своїм розмірам, . акуторострати має довгий травний тракт, що передбачає різноманітний склад мікробіоти кишечника з різних сегментів кишкового тракту (ІТС). Однак ці композиції в даний час невідомі. Отже, порівняння мікробіоти кишечника між різними ІТС . акуторострат може дати нові уявлення про перетравлення їжі та метаболізм.