Colloque ICP 2016 - Модифікації мікробіоти кишечника кролика, викликані підвидом Mycobacterium avium

Представлений: Ракель Арразурія
Анотація типу: Усна презентація
Тип сесії: Курс зараження та відповідь господаря
Автор Спікер: Ракель Арразурія

модифікації

Олена Моліна 1, Ікер А. Севілья 1, Міріам Серрано 1, Хооман Дерахшані 2, Ехсан Хафіпур 2,3, Валентин Перес 4, Хосеба Гаррідо 1, Рамон А. Жусте 1,5, Наталія Ельгезабал 1

1 NEIKER-Tecnalia, Баскський інститут сільськогосподарських досліджень та розробок, Деріо, Бізкая, Іспанія; 2 Кафедра наук про тварин, Університет Манітоби, Вінніпег, МБ, Канада; 3 Кафедра медичної мікробіології, Університет Манітоби, Вінніпег, МБ, Канада; 4 кафедра охорони здоров’я тварин факультету ветеринарної медицини університету Леона, Іспанія; 5 SERIDA, Департамент сільського господарства регіонального уряду Князівства Астурія, Дева, Астурія, Іспанія.

MAP-інфекція була пов'язана з дисбіозом мікробіоти кишечника у жуйних. Крім того, дієта є одним із ключових факторів, що впливає на баланс мікробної популяції в травному тракті, і вона показала, що модулює MAP-інфекцію на кролячій моделі. У цьому дослідженні ми мали намір додатково проаналізувати цю зміну прогресування інфекції, пов’язаної зі зміною раціону, і з’ясувати, чи спостерігаються варіації мікробного складу в моделі інфікування кроликів MAP за різних дієтичних умов.

Інфекційний статус та мікробний склад вивчали у 20 новозеландських кроликів. Половину цих кроликів годували регулярною дієтою протягом усього експерименту (виклик n = 5, контроль n = 5). Решта кроликів отримували дієту з високим вмістом клітковини під час виклику (виклик n = 5, контроль n = 5). Інфекцію оцінювали за допомогою qPCR та гістопатології кишкових лімфоїдних тканин. Вміст мікробіоти sacculus rotundus та сліпої кишки вивчали шляхом секвенування генів 16S рРНК. Програмний пакет QIIME використовувався для аналізу мікробної спільноти. Прогнозне функціональне профілювання на основі метаболічного шляху KEGG проводили за допомогою PICRUSt.