Естонія - Незалежність втратила Британіку
Долю Естонії вирішив Німецько-радянський пакт про ненапад від нацистської Німеччини та СРСР у серпні 1939 р. 28 вересня радянський уряд наклав на Естонію договір про взаємодопомогу, який поступився Радянському Союзу кількома естонськими військовими базами, які були окуповані негайно. Було призначено широкомасштабний неполітичний уряд під керівництвом Юрі Улуотса, але 16 червня 1940 р. Радянський ультиматум вимагав нового естонського уряду, "здатного і бажаючого забезпечити чесне застосування радянсько-естонського договору про взаємодопомогу". Наступного дня радянські війська окупували всю країну. 21 липня Палата депутатів отримала резолюцію про приєднання до СРСР; він був одноголосно прийнятий наступного дня, незважаючи на суперечність конституційній процедурі. 6 серпня Верховна Рада Москви включила Естонію до складу СРСР як одну з республік, що входять до її складу. Тим часом Петс, Лайдонер та багато інших політичних лідерів були заарештовані та депортовані до СРСР. За перші 12 місяців радянської окупації було вбито або депортовано понад 60 000 осіб; понад 10000 було вивезено під час масової депортації в ніч з 13 на 14 червня 1941 року.
22 червня 1941 р. Німеччина напала на СРСР. Великі райони Естонії були звільнені від радянських сил імпровізованими естонськими частинами до того, як німецька армія дійшла до Естонії. Протягом трьох років Естонія перебувала під німецькою окупацією, ставши частиною провінції Остланд. Однак до лютого 1944 року росіяни повернулися на Нарвський фронт. Близько 30 000 естонців втекли морем до Швеції та 33 000 до Німеччини; багато тисяч загинули в морі. 22 вересня 1944 року радянські війська взяли Таллінн.
Радянська республіка
Перше повоєнне десятиліття було особливо важким періодом репресій та русифікації. Зусилля режиму реструктурувати країну за радянською формою зробили національне політичне та культурне життя практично неможливим. Масові депортації відбувалися кількома хвилями, найзначніше в 1949 р. Під час кампанії з колективізації сільського господарства. За підрахунками, між 1945 і 1953 роками було депортовано 80 000 естонців. Масові імміграції з Росії та інших частин США зменшили частку корінного населення. До війни етнічні естонці складали майже 90 відсотків населення. До 1990 року ця частка впала приблизно до 60 відсотків. Правляча комуністична партія мала непропорційно іммігрантський характер. Масштабна чистка в 1950–1951 рр. Практично не залишила численних естонських чиновників на найвищих посадах. Ситуація дещо змінилася наприкінці 1950-х - на початку 1960-х років, але до кінця 1980-х років правляча еліта все ще була в значній мірі іммігрантом.