Monocot - огляд тем ScienceDirect

Монокоти мають короткочасний первинний корінь, що дозволяє іншим типам коренів, таким як насіннєві та додаткові корені, отримані від пагонів, домінувати над кореневою системою.

Пов’язані терміни:

  • Вкладений ген
  • Мутація
  • Філогенез
  • Рід
  • Ячмінь
  • Кукурудза
  • Покритонасінні
  • Евдікот
  • Арабідопсис

Завантажити у форматі PDF

Про цю сторінку

Органелярні РНК-полімерази вищих рослин

Вольфганг Р. Гесс, Томас Бернер, у International Review of Cytology, 1999

2 Монокоти

У однодольних місцях місце ініціювання транскрипції здається менш збереженим, ніж у дводольних. Ініціація може відбуватися у A або G, а іноді навіть у T нуклеотидів (рис. 4). Збереження послідовностей у місці початку транскрипції між дводольними та однодольними у багатьох випадках включає елемент послідовності 5'-CRTA-3 '. Однак визначення восьми транскриптів 5 'кінців у Сорго виявило YRTA, варіант мотиву CRTA, у чотирьох з аналізованих послідовностей як консенсусну послідовність (консенсус більшості), тоді як в інших чотирьох промоторах цей мотив був далі вироджений в AATA або CTTA (рис. 4, вторинний консенсус; Ян та Прінг, 1997).

sciencedirect

Рис.4. Місця ініціювання транскрипції в мітохондріях однодольних рослин. Мотиви консенсусу демонструються окремо для Sorghum, Triticum aestivum та Zea sp. в кінці кожного блоку послідовностей. Y, D, H, K, R, W відповідають прийнятим скороченням IUB: Y [= T, C], R [= A, G], D = [G, A, T], H = [A, T, C], K = [G, T], і W = [A, T]. Інші позначення є такими, як описано в легенді до рис. 3 .

Мотив CRTA, знайдений у більшості промоторів, є основною послідовністю центрального домену 12-нуклеотидів, який простягається від - 7 до + 5. Крім того, більшість промоторних областей в мітохондріях однодольних рослин можуть мати невеликий загальний елемент, багатий пурином область, розташована в положенні від 12 до - 9 (Rapp et al., 1993; Tracy and Stern, 1995), що нагадує структуру промотора P. sativum atp9, як визначили Binder et al. (1995) з досліджень транскрипції in vitro.

Промотори, які значно відхиляються від більшості інших промоторів, також були описані для однодольних мітохондрій. Одним з таких прикладів є умовний (cpc) промотор cox2 (рис. 4) Z. perennis, який не може бути транскрибований системою Z. mays in vitro і який вимагає присутності домінантного ядерного алелю (МСТ) для активності in vivo ( Ньютон та ін., 1995).

Роль факторів транскрипції TCP у формуванні будови квітів, морфології листків та архітектурі рослин

Майкл Ніколас, Пілар Кубас, у “Фактори транскрипції рослин”, 2016

16.4.2 Гени CYC/TB1 контролюють асиметрію квіток у монокотах

На додаток до своєї ролі у контролі за зростанням пахвових бруньок, кукурудза TB1 (група 18; Mondragón-Palomino and Trontin, 2011) може сприяти аборту тичинок у жіночих квітках, оскільки накопичення мРНК TB1 виявляється у зародках тичинок жіночого квітки, що пізніше переростати в арештовані стаміноди (Hubbard et al., 2002).

Біохімія глікокон'югованих гліканів; Вуглевод-опосередковані взаємодії

E.J.M. Ван Дамм,. W.J.Peumans, у всеосяжній гліконауці, 2007

3.26.3.1.6 Монокоти Лектини, що зв’язують людину

Назва монокот Лектини, що зв’язують людини, була введена як збірний іменник у середині 90-х років для групи тісно пов’язаних між собою лектинів, які виявляють виняткову специфічність щодо маннози і до того часу, здавалося, обмежувались кількома таксонами однодольних (Liliopsida). 81 Хоча цей термін був доречним на той час, цей термін став занадто обмежувальним, оскільки дуже схожі лектини були виявлені в інших рослинах, крім Liliopsida, а також у бактеріях 82,83 та тваринах. 84 Отже, переважно називати сім’ю на честь першого ідентифікованого члена (по-іншому аглютинін G. nivalis або GNA) і замінити застарілий термін, наприклад, „пов’язаними з GNA рослинними лектинами”. 5

Малюнок 6. Схематичний огляд синтезу та будови лектинів, пов’язаних з GNA. Кодами лектину є: LOMBP, Listera ovata мономерний зв’язуючий людини білок; LOA, Listera ovata агглютинін; ASA-I, аглютинін I цибулини цибулини Allium sativum; АМА, аглютинін Arum maculatum; GNA, аглутинін Galanthus nivalis; TxLC-I, гібридний лектин Tulipa C-I. Ключ до символів на малюнку див. У легенді на рисунку 1.

Більшість ортологів вакуолярного GNA, що характеризуються до цього часу, були виділені з вегетативних тканин. Як правило, вони містять багато білків, що становлять від 1% до 10% від загального білка. У деяких типових вегетативних органах зберігання на них припадає> 50% загального білка. Вакуолярні ортологи GNA, очевидно, рідше зустрічаються в насінні. До цього часу було описано лише одиничний лектин (від H. moerenhoutiana).

Окрім численних «вакуолярних» лектинів, пов’язаних з GNA, у T. aestivum, Z. mays та Medicago truncatula було виявлено декілька виражених «цитоплазматичних GNA-ортологів». 5 На даний момент відповідні білки ще не виділені та не охарактеризовані. Однак відкриття цих цитоплазматичних ортологів GNA має важливі наслідки для розкриття фізіологічної ролі та молекулярної еволюції рослинних лектинів (див. Нижче).

Лектини, пов’язані з GNA, вважаються сімейством специфічних для людини лектинів. Хоча всі вони пов'язують один і той же моносахарид, пов'язані з GNA лектини з різних рослин демонструють помітні відмінності у тонкій специфічності щодо олігоманозидів. 94,95 Деякі домени GNA, мабуть, виявляють іншу моносахаридну специфічність. Наприклад, один із двох доменів лектину лектину тюльпана TxLC-I, очевидно, розпізнає GalNAc. 96 Варто також згадати, що не всі домени GNA мають три функціональні сайти, що зв'язують людини. Визначено домени GNA, в яких один або два сайти неактивні. 97 Більше того, у плодах Curculigo latifolia був виявлений солодкий білок, який має високу ідентичність послідовності з GNA, але повністю позбавлений зв’язуючої цукру активності. 98

Секвенування геному A. thaliana виявило появу великої кількості генів, що кодують химерні білки з доменом, який поділяє розумну ідентичність послідовності з GNA. Оскільки жоден з цих білків ще не ідентифікований, і, крім того, залишається сумнівним, чи мають (усічені) домени GNA які-небудь функціональні вуглеводнезв'язувальні сайти, ці химерні білки тут не обговорюються. Те саме стосується подібних білків/генів, що містяться в інших рослинах.

Фактори транскрипції CUC: до меристеми та не тільки

Од Моугарні,. Патрік Лауфс, у “Фактори транскрипції рослин”, 2016

15.4.2.2 Еволюція та спеціалізація генів MIR164

miR164 міститься у дводольних, однодольних та голонасінних рослинах, що вказує на те, що, подібно до його цільових генів NAC, він, ймовірно, був присутній у останнього загального предка голонасінних та покритонасінних рослин (Розділ 15.2.1.2; Axtell and Bartel, 2005). Кілька генів кодують miR164: 3 у Arabidopsis, але до 12 у сої. Зрілі гени miR164, кодовані різними членами, можуть бути ідентичними, наприклад, у сої, або демонструвати невеликі варіації послідовностей, як у Arabidopsis, в яких зрілий miR164c відрізняється на один нуклеотид від зрілого mir164a або mir164b. Дослідження evo-devo про сімейство MIR164 дозволяє припустити, що у останнього спільного предка існуючих покритонасінних рослин були дві лінії: клада В, що містить ген Arabidopsis MIR164B, члени якого, як правило, сильно виражені в коренях; та інша клада, члени якої, такі як гени Arabidopsis MIR164A та C, як правило, менш виражені в коренях, ніж в інших тканинах (Jasinski et al., 2010).