Оцінка полігенного ризику ожиріння та якості, кількості та строків придбання їжі на робочому місці

Ролі Концептуалізація, Формальний аналіз, Розслідування, Методологія, Програмне забезпечення, Написання - оригінальний проект, Написання - огляд та редагування

полігенного

Партнерський центр геномної медицини, Масачусетська лікарня загального користування та Гарвардська медична школа, Бостон, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки, Широкий інститут, Кембридж, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки, Департамент анестезії, критичної допомоги та медицини болю, Массачусетська лікарня та Гарвард Медична школа, Бостон, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки

Ролі Концептуалізація, методологія, написання - огляд та редагування

Афіліаційний відділ медицини населення, Гарвардська медична школа, Гарвардський інститут охорони здоров'я "Пілігрим", Бостон, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки, відділ діабету, загальна лікарня штату Массачусетс, Бостон, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки

Ролі Концептуалізація, методологія, написання - огляд та редагування

Дочірній центр з питань охорони здоров’я Інституту Монгани, Массачусетська лікарня, Гарвардська медична школа, Бостон, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки

Ролі Курація даних, написання - огляд та редагування

Афілійований відділ загальної внутрішньої медицини, Медичний факультет, Масачусетська лікарня загального користування та Гарвардська медична школа, Бостон, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки

Ролі Концептуалізація, методологія, написання - огляд та редагування

Партнерський центр геномної медицини, Масачусетська лікарня загального користування та Гарвардська медична школа, Бостон, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки, Широкий інститут, Кембридж, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки, Департамент анестезії, критичної допомоги та медицини болю, Массачусетська лікарня та Гарвард Медична школа, Бостон, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки

Ролі Концептуалізація, курація даних, дослідження, методологія, ресурси, нагляд, перевірка, візуалізація, написання - оригінальний проект

Афілійований відділ загальної внутрішньої медицини, Медичний факультет, Масачусетська лікарня загального користування та Гарвардська медична школа, Бостон, штат Массачусетс, Сполучені Штати Америки

  • Хасан С. Дашті,
  • Марі-Франс Хіверт,
  • Дуглас Е. Леві,
  • Джессіка Л. МакКерлі,
  • Річа Саксена,
  • Енн Н. Торндайк
  • Стаття
  • Автори
  • Метрики
  • Коментарі
  • Висвітлення в ЗМІ
  • Експертна оцінка

Цифри

Анотація

Передумови

Вплив генетичного ризику ожиріння на поведінку при виборі їжі невідомий і може бути причиною між генетичним ризиком та збільшенням ваги. Метою цього дослідження було вивчити зв'язок між генетичним ризиком ожиріння та поведінкою вибору їжі за допомогою об'єктивно оцінених покупок їжі на робочому місці.

Методи та висновки

Дані поточного дослідження обмежені учасниками, які погодились надати генетичні дані та мають європейське походження (обмежено, щоб уникнути питань розшарування популяції та узгоджуватися з ГВАС, виявленими в популяціях європейського походження). Аналізи проводились з використанням даних опитування та стану здоров'я, зібраних під час базового візиту до початку батьківського пробного втручання, а дані кафетеріїв збиралися ретроспективно за 3 місяці до зарахування. Ми використовували 3 місяці для представлення типових та звичних покупок та уникнення порушень через короткострокові відпустки чи зміни графіку роботи. З 602 учасників 499 погодились на генотипування, а 397 були європейцями та були включені в поточний аналіз (S1 Рис).

Покупки на робочому місці, антропометрія та дієтичні змінні

Протягом досліджуваного періоду в лікарняному містечку було 6 пунктів харчування, включаючи 3 кафетерії з повним набором послуг та 3 менші кафе (надалі всі вони називаються "кафетеріями"). Кафетерії, як правило, працювали 5 або 7 днів на тиждень і пропонували сніданок та обід вранці до обіду та обмежені закуски/додаткові та вечері вечорами та ночами. Протягом дня пропонується понад 1200 різних продуктів, включаючи страви та закуски (наприклад, гарячі страви, приготовані бутерброди та салати та піца), великий салатний бар, закуски та десерти, а також гарячі та холодні напої. Усі співробітники дослідження сплачували за предмети їдальні шляхом вирахування заробітної плати за допомогою ідентифікаційного значка працівника, а покупки відстежувались за допомогою даних про продажі в кафетеріях [16].

Усі лікарняні їдальні маркували їжу та напої світлофорними ярликами, як це було докладно описано в інших місцях [17,18], і ця система маркування застосовується в лікарні з 2010 року. Коротко, система маркування світлофорів була розроблена персонал лікарняного харчування на основі дієтичних рекомендацій USDA [19,20]. Кожен предмет був позначений як червоний, жовтий або зелений на основі алгоритму, який враховував калорії, вміст насичених жирів та щільність поживних речовин. Зелений рейтинг означав найвищий рівень здоров’я, а червоний - найнижчий рівень (наприклад, найменш здоровий). Варіанти розподілялися приблизно рівномірно між тими, хто позначений зеленим (34%), жовтим (37%) або червоним (29%). Середні витрати на червоні, жовті та зелені предмети були порівнянними для напоїв, закусок та закусок/допоміжних продуктів, і предмети за різними цінами були доступні в кожній кольоровій категорії [16].

Вагу та зріст учасників вимірювали медичні працівники клінічних досліджень під час базового візиту, а ІМТ розраховували як вагу/зріст 2 (кг/м 2). Учасники також провели он-лайн опитування, яке забезпечило власну звітність про вік, стать, звички пропускати їжу («ЗА МИНУЛИЙ ТИЖдень, скільки днів ви пропустили сніданок/обід/вечерю з будь-якої причини?»; Ніколи, 1-2 дні, 3–4 дні, 5–6 днів і кожен день), а також звички їжі, що готуються вдома (“Протягом минулого тижня, скільки днів ви їли ЗАВТРАК/ОБІД/ВЕЧЕРЮ, який готували вдома [включаючи страви що ви приносите на роботу]? "; Ніколи, 1-2 дні, 3-4 дні, 5-6 днів та кожен день).

Генотипування генетичних даних, імпутація та контроль якості

ДНК витягували із зразків крові, відібраних у 499 учасників, та генотипували за допомогою програми Infinium Global Screening (GSA) Array-24 v2.0. Імпутація проводилась із використанням сервера Michigan Imputation із довідковою панеллю Haplotype Reference Consortium (HRC, версія r1.1 2016) для імпутації [21]. Ця панель HRC складається з 64 940 гаплотипів переважно європейського походження. Фазовування гаплотипів проводили за допомогою Eagle v2.3 [22]. Низькоякісні генетичні маркери при нерівновазі Харді-Вайнберга (P −6), низька частота незначних алелів (медіана + 3 * IQR), але жоден не був виключений.

Походження учасників було визначено за допомогою TRACE [23] та Проекту розмаїття геному людини (HGDP) [24] як еталонної панелі. Вибіги для аналізу основних компонентів визначали за допомогою проекції аналізу основних компонентів досліджуваних зразків на еталонні зразки HGDP і згодом були виключені з аналізу (n = 100 виключено). Щоб виправити стратифікацію популяції, ми обчислили основні компоненти походження за допомогою TRACE [23] у підмножині з генетично європейськими походженнями. Крім того, зв’язок зразків визначали за допомогою PLINK [25], і згодом 1 зразок з кожної виявленої спорідненої пари (пі-шапка> 0,25) був виключений.

Генерація PRS