PhoB - фосфатний регулон-транскрипційний регуляторний білок PhoB - Pseudomonas aeruginosa (штам

Оцінка анотацій: 4 з 5

Оцінка анотацій забезпечує евристичний показник вмісту анотації запису UniProtKB або протеома. Цей рахунок не може використовувати як міру точності анотації, оскільки ми не можемо визначити „правильну анотацію” для будь-якого даного білка.

- Білок, виведений з гомології i

Це вказує на тип доказів, що підтверджують існування білка. Зауважте, що докази „існування білка” не дають інформації про точність або правильність відображених послідовностей.

Виберіть розділ ліворуч, щоб переглянути вміст.

Цей розділ містить будь-яку корисну інформацію про білок, переважно біологічні знання.

Регіони

Цей підрозділ розділу "Функція" визначає положення та тип кожного ДНК-зв'язуючого домену, присутніх у білку.

Інформація, перевірена вручну, яка була створена системою автоматичних анотацій UniProtKB.

Твердження вручну згідно з правилами i

Проект генної онтології (GO) забезпечує набір ієрархічно керованої лексики, розділеної на 3 категорії:

GO - Молекулярна функція i

Висновок з біологічного аспекту Предка

Тип філогенетичних доказів, згідно з якими аспект нащадка виводиться через характеристику аспекту родового гена.

Більше інформації в посібнику з коду доказів GO

Висновок з біологічного аспекту предка i

GO - Біологічний процес i

Висновок з мутантного фенотипу

Описує анотації, які зроблені на підставі вивчення варіацій або змін у генному продукті, таких як мутації або аномальні рівні, та включає такі методи, як нокаути, надмірна експресія, експерименти проти сенсу та використання специфічних інгібіторів білка.

Більше інформації в посібнику з коду доказів GO

Виведено з мутантного фенотипу i

Виведено з шаблону виразу

Охоплює випадки, коли анотація виводиться з часу або місця експресії гена.

Більше інформації в посібнику з коду доказів GO

Виведено з шаблону виразу i

Ключові слова UniProtKB складають контрольований словник з ієрархічною структурою. Ключові слова узагальнюють зміст запису UniProtKB та полегшують пошук цікавих білків.

Бази даних ферментів та шляхів

Збірник баз даних про шляхи/геном BioCyc

Цей розділ містить інформацію про назви білка та гена та синонім (и) та про організм, що є джерелом білкової послідовності.

Імена та таксономія i

Цей підрозділ розділу "Назви та систематика" містить вичерпний перелік усіх назв білка, від загальновживаних до застарілих, що дозволяє однозначно ідентифікувати білок.

Цей підрозділ розділу "Імена та таксономія" вказує на ім'я (і) гена (генів), що кодує послідовність (і) білка, описану у цій статті. Існують чотири різні маркери: 'Ім'я', 'Синоніми', 'Впорядковані імена локусів' та 'Імена ORF'.

Цей підрозділ розділу "Імена та систематика" містить інформацію про назви (імена) організму, що є джерелом білкової послідовності.

Цей підрозділ розділу Імена та таксономія показує унікальний ідентифікатор, присвоєний NCBI вихідному організму білка. Це називається `` таксономічним ідентифікатором '' або `` таксисом ''.

Цей підрозділ розділу "Імена та систематика" містить таксономічну ієрархічну класифікаційну лінію вихідного організму. У ньому перелічуються вузли, як вони з’являються зверху вниз у таксономічному дереві, а спочатку перелічується більш загальна група.

Цей підрозділ розділу Імена та таксономія присутній для записів, які є частиною протеома, тобто набору білків, які, як вважається, експресуються організмами, геноми яких були повністю секвендовані.

Протеом UniProt може складатися з декількох компонентів.
Назва компонента відноситься до геномного компонента, що кодує набір білків.

Бази даних про організм

База даних геному псевдомонади

Цей розділ містить інформацію про розташування та топологію зрілого білка в клітині.

Субклітинне розташування i

GO - Клітинний компонент i

цитозоль Джерело: GO_Central Висновок з біологічного аспекту предка i

Ключові слова - Клітинний компонент i

Цей розділ містить інформацію про захворювання (и) та фенотип (и), пов’язані з білком.

Патологія та біотехнології i

Цей підрозділ розділу "Патологія та біотехнології" описує ефекти in vivo, спричинені абляцією гена (або однієї або декількох транскриптів), що кодує білок, описаний у цій статті. Це включає нокаут і нокдаун генів, за умови, що експерименти проводились у контексті цілого організму або певної тканини, а не на рівні одноклітинних.

Фенотип порушення i

Інформація, вироблена вручну, для якої є опубліковані експериментальні дані.

---