Топографія поверхні білка як інструмент для посилення селективної активності калієвого каналу
↵ 1 Ці автори зробили однаковий внесок у цю роботу.
За редакцією Вольфганга Петі
Анотація
Tk-hefu - це штучний пептид, розроблений на основі скелі α-шпильки, який вибірково блокує калієві канали Kv1.3, керовані напругою. Тут ми представляємо його просторову структуру, дозволену ЯМР-спектроскопією, та аналізуємо її взаємодію з каналами за допомогою комп’ютерного моделювання. Ми застосовуємо топографію білкової поверхні, щоб запропонувати мутації та збільшити спорідненість до Tk-hefu до ізоформи каналу Kv1.3. Ми перепроектували функціональну поверхню Tk-hefu, щоб краще відповідати відповідній поверхні каналу порового тамбура. Отриманий пептид Tk-hefu-2 зберігає селективність Kv1.3 і виявляє в ~ 15 разів більшу активність порівняно з Tk-hefu. Ми експериментально перевіряємо режим зв'язування Tk-гефу-2 із зовнішнім вестибюлем каналу за допомогою сайт-спрямованого мутагенезу. Ми стверджуємо, що інженерія будівельних лісів за допомогою топографії поверхні білка є надійним інструментом для проектування та оптимізації конкретних лігандів іонних каналів.