Зміни вірусу слизової оболонки кишечника при виразковому коліті Кишечник
Об’єктивна Патогенез UC пов'язаний з дисбіозом мікробіоти кишечника. Ми постулюємо, що зміни вірусного співтовариства, що заселяють слизову кишечника, відіграють важливу роль у патогенезі UC. Це дослідження має на меті охарактеризувати віром слизової оболонки та їх функції в галузі здоров'я та UC.
Дизайн Глибоке метагеномічне секвенування вірусоподібних препаратів частинок та бактеріальне секвенування 16S рРНК проводили на слизовій прямої кишки 167 суб’єктів із трьох різних географічних регіонів Китаю (UC = 91; здоровий контроль = 76). Зміни вірому та бактеріомів у слизовій оболонці UC оцінювали та корелювали з метаданими пацієнта. Ми застосували розподіл навколо алгоритму кластеризації медоїдів та класифікували вірусні спільноти слизової оболонки на два кластери, які називаються метакоммунітетами вірусу слизової оболонки 1 та 2.
Результати У UC спостерігалося розширення вірусів слизової оболонки, особливо бактеріофагів Caudovirales, і зменшення різноманітності, багатства та рівномірності слизової Caudovirales порівняно зі здоровими групами контролю. Змінений віром слизової оболонки корелює із запаленням кишечника. Інтеріндивідуальна несхожість між вірусами слизової оболонки була вищою в UC, ніж контрольна група. Фаг Escherichia та фаг Enterobacteria були більш поширеними в слизовій оболонці UC, ніж контролі. У порівнянні з метакомунітетом 1, метакоммунітеті 2 переважали суб'єкти UC і демонстрували значну втрату різних вірусних видів. Пацієнти з UC продемонстрували значне скасування різноманітних вірусних функцій, тоді як множинні вірусні функції, особливо функції бактеріофагів, пов'язаних з придатністю та патогенністю бактерій-господарів, помітно збагачувались на слизовій оболонці UC. Інтенсивні кореляційні зв'язки між вірусами слизової оболонки та бактеріями значно виснажились в UC.
Висновок Ми вперше продемонстрували, що UC характеризується суттєвими змінами слизової оболонки virobiota з функціональними спотвореннями. Збагачення бактеріофагів Caudovirales, посилення функцій вірулентності фагів/бактерій та втрата вірусно-бактеріальних кореляцій у слизовій оболонці UC підкреслюють, що виром слизової оболонки може відігравати важливу роль у патогенезі UC.
- слизова кишечника
- virome
- бактерії
- метакоммунітет virome
- виразковий коліт
Це стаття з відкритим доступом, що розповсюджується відповідно до ліцензії Creative Commons Attribution Non Commercial (CC BY-NC 4.0), яка дозволяє іншим розповсюджувати, реміксувати, адаптувати, не комерційно використовувати цей твір та ліцензувати їх похідні роботи на різні умови, за умови належного цитування оригіналу твору, надання належного кредиту, зазначених змін та використання некомерційного характеру. Див .: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/.
Статистика від Altmetric.com
Значення цього дослідження
Що вже відомо з цього приводу?
Повідомлялося про зміну показників бактерій у фекаліях та вирому фекалій у пацієнтів із ВЗК.
Пацієнти з UC продемонстрували збільшення вмісту бактеріофагів Caudovirales та видів Caudovirales у калі.
Які нові висновки?
Ми вперше продемонстрували, що UC характеризується змінами в слизовій оболонці virobiota з функціональними спотвореннями.
Слизова UC показала велику кількість ДНК-вірусів, зокрема бактеріофагів Caudovirales, але низьку різноманітність, багатство та рівномірність Caudovirales. Запалення слизової оболонки кишок було пов’язане з цими змінами.