L-бокс регулон Лізин зондування провідними РНК генів біосинтезу бактеріального лізину PNAS

Відредаговано Сьюзен Готтесман, Національний інститут охорони здоров’я, Бетесда, доктор медичних наук, та затверджено 20 серпня 2003 року

регулон

L-гени біосинтезу лізину. (A) Шлях біосинтезу лізину у B. subtilis. Виявлено, що гени містять лідери L-боксу в будь-якому організмі (див. Таблицю 2, яка опублікована як допоміжна інформація на веб-сайті PNAS, www.pnas.org), а відповідний ферментний продукт наведено в дужках. У В. subtilis виявлено три гени, що кодують аспартокіназу; lysC кодує аспартокіназу II, реагуючу на лізин форму ферменту. Альтернативні ролі сполук на цьому шляху показані пунктирними стрілками. (B) Структури лізину та споріднених сполук.

Структурна модель лідера B. subtilis lysC. Нумерація відносно початкової точки транскрипції (10). Спіралі 1–5 позначені позначками в коробках. Т, термінатор; AT, антитермінатор; ААТ, анти-антитермінатор. Антитермінатор утворюється шляхом сполучення залишків із позицій 191–217 із залишками із позицій 223–255. Червоні залишки знайдені у 100% послідовностей, а сині залишки у> 80% послідовностей (рис. 5); зелені залишки та пунктирні лінії показують можливу третинну взаємодію між петлями спіралей 2 та 3. Порожнисті малі літери вказують на мутації, раніше показані, щоб викликати стійкість до AEC та/або конститутивну експресію lysC (посилання 9 та 10 та H. Paulus, особисте спілкування ). Мутації, побудовані в цьому дослідженні (Xba-1, Xba-2, Xba-3), позначені суцільними малими літерами. Зміни послідовності у мутантів: Xba-1, A31U/A32C/G33U/U35G; Xba-2, G108U/C110U/G111A/A112G; Xba-3, A198C/C200A/U201G/C202A. Елементи мотива S-turn та GA позначені маркуванням.