Що таке систематичний огляд
Систематичні огляди збирають та аналізують документи, щоб знайти відповіді на важливі питання. sysrev.com робить революційний огляд сучасним веб-додатком та штучним інтелектом.
Sysrev.com - це безкоштовний інструмент, який об’єднує принципи відкритого доступу в систематичний огляд літератури, щоб створити новий вид повністю відтворюваного огляду літератури. Сисрев вже використовується в сотнях публічних проектів, 15 з яких відповідають лише запиту "рак".
Якщо ви хочете розпочати зараз, просто відвідайте цільову сторінку та підпишіться - sysrev є безкоштовним для публічних проектів. Ви також можете скористатися нашим коротким посібником, щоб допомогти вам розпочати роботу на blog.sysrev.com/getting-started.
У цій публікації ми пояснюємо, як працюють систематичні огляди та як їх виконувати за допомогою новітніх обчислювальних інструментів.
Що таке систематичний огляд?
Сисрев можна розділити на 4 етапи:
- Встановіть чіткий Об’єктивна
- Пошук для відповідної літератури
- Екран літератури та Витяжка даних
- Звіт результати
Завдання: У систематичному огляді 2004 року Баріатрична хірургія - систематичний огляд та мета-аналіз Бухвальд прагнув "визначити вплив баріатричної хірургії на втрату ваги, результат оперативної смертності та 4 супутні захворювання ожиріння" [1]. Ці 3 цілі чітко визначають мету огляду. Якщо правильно відповісти, вони можуть змінити спосіб проведення баріатричної хірургії.
Насправді результати цих досліджень мають суттєвий вплив, на вищезгадану публікацію згадувалось більше 6000 разів, що робить її одним з найавторитетніших джерел з баріатричної хірургії.
Систематичні огляди можуть мати значний вплив на дослідження та практику. Зліва вчений Google визначає систематичний огляд баріатричної хірургії як 6813 цитат. Праворуч Semantic Scholar визначає 183 публікації, де це було "дуже впливово".
Цілі - це все-таки людські зусилля. Починати будь-який проект допомагає чітке уявлення про те, чого ви хочете досягти. Чіткі цілі допомагають інформувати кожен другий крок огляду та дозволяють визначити, чи рухаєтесь ви до кінця.
Деякі цілі з часом можуть бути автоматизовані, зокрема цілі, які можна узагальнити. Запитання на кшталт "Які методи лікування найбільш ефективні проти хвороби х?" та "Які генетичні варіанти викликають побічні реакції на лікування z?" можуть бути поставлені та вирішені методами обробки природними мовами. Однак ці питання спираються на деяке систематичне розуміння побічних реакцій, захворювань та методів лікування.
Тут є корисним іменування та визначення категорій, властивостей та відносин за допомогою формальних онтологій, але нинішні інструменти огляду лише розпочали цю практику. Онтології - це метод представлення мови зрозумілим для комп’ютерів способом. Базу даних медичної тематики NCBI (MESH) можна вважати онтологією, а ливарний завод OBO містить багато онтологій, що завантажуються, захворювань, ліків, генів тощо.
Пошук: Щоб відповісти на ціль, слід формувати ретельні пошукові запити, щоб неупереджено знаходити документи, що стосуються даної теми. Більші огляди літератури іноді містять кілька баз даних медичної літератури. Огляд Бухвальда використовує MEDLINE, Current Contents та Кокранівську бібліотеку для збору 2738 цитат [1].
Оглядові публікації іноді містять схему, що детально описує кількість рецензованих статей. На жаль, як правило, неможливо отримати прямий доступ до зібраних цитат у традиційному систематичному огляді. Однак обчислювальні інструменти можуть дозволити дослідникам представити більшу прозорість у своєму процесі огляду, оприлюднюючи всі дані, отримані під час їхнього розгляду. Сюди входить те, які статті були зібрані.