Скринінг умов, що сприяють кристалізації олігопептидази В із Серратії
Анотація
Олігопептидази B (OpdB) - це дводоменні серинові пептидази з трипсиноподібною субстратною специфічністю, що належать до сімейства проліл-олігопептидаз. Ці ферменти беруть участь у патогенезі трипаносомозу, лейшманіозу, інших паразитарних інфекцій, а в деяких випадках і бактеріальних інфекцій, і є потенційними мішенями для розвитку терапевтичних протиінфекційних засобів. Визначено лише дві тривимірні структури ферментів цього класу. Обидва ці ферменти були з найпростіших, тоді як структури бактеріальних OpdBs невідомі. Диференціальну скануючу флуориметрію (термофлюор) застосовували для підвищення ефективності скринінгу умов кристалізації OpdB з бактерії Serratia proteamaculans (PSP). Було встановлено, що низькомолекулярні поліаміни можуть стабілізувати PSP у розчині. Кристал PSP, який був вирощений методом дифузійної пари у присутності сперміну, був використаний для збору даних рентгенівської дифракції, встановлених з роздільною здатністю 1,88 Å на джерелі синхротронного випромінювання в Національному дослідницькому центрі «Курчатовський інститут».