Виявлено новий механізм на шляху реагування на пошкодження ДНК
Розрахована структура нуклеосомних петель ДНК, які тимчасово утворюються під час транскрипції хроматину, що містить інтактну ДНК, РНК-полімеразою II (Pol II). За наявності одноцепочечного розриву ДНК петльова структура, ймовірно, змінюється, перешкоджаючи обертанню РНК-полімерази вздовж спіралі ДНК (помаранчева стрілка). [Надія С. Герасимова та ін.]
Пошкодження ДНК часто виникає як побічний продукт нормальних клітинних метаболічних функцій. На щастя, клітини розробили безліч механізмів для надзвичайно ефективного видалення пошкодженої ДНК, оскільки відхилені шляхи відновлення були тісно пов’язані з різними захворюваннями, особливо раком. Одне з конкретних пошкоджень ДНК, яке відбувається найчастіше, полягає в тому, що фосфатний зв’язок на ланцюзі ДНК, який пов’язує дві сусідні основи нуклеотидів, розривається - процес, який вчені називають розривом одиночного набору.
Зараз спільна група дослідників виявила новий механізм, який клітини використовують для корекції SSBs під час транскрипції через хроматин. Розуміння даних цього дослідження є критично важливим, оскільки неремонтовані SSBs є основною загрозою для геномної стабільності і можуть різко перешкоджати транскрипції, реплікації та репарації ДНК.
“У вищих організмів ДНК зв’язується з білками в комплексах, які називаються нуклеосомами. Кожні приблизно 200 пар основ організовані в нуклеосоми, що складаються з восьми білків гістонів, які, подібно нитці на бобіні, намотують подвійну спіраль ДНК, яка згортається у дві перекручені петлі. Частина поверхні спіралі ДНК прихована, оскільки вона взаємодіє з гістонами. Весь наш геном упакований таким чином, за винятком областей, з яких в даний час зчитується інформація », - пояснив старший автор Василь Студицький, к.т.н., завідувач лабораторії регулювання транскрипції та реплікації МДУ ім. Ломоносова.