Асоціація батьківських генетичних, життєвих та соціальних факторів, що визначають стан здоров’я, з потомством
Кетрін А. Грем
Факультет наук про здоров'я та життя
Оксфордський університет Брукса
Headington Road, Oxford OX3 0BP (Великобританія)
Статті, пов’язані з "
- Електронна пошта
Анотація
Вступ
Багато ОНП були визначені як однозначно пов'язані з рисами, пов'язаними з ожирінням, про які за межами асоціації відомо мало [5, 6]. Не повідомлялося, що лише SNP прирівнюються до клінічної прогностичної цінності [5]; однак у поєднанні з факторами L&SD прогнозована сила досягає значущості [6, 7, 10, 11]. Про найсильнішу прогнозовану силу нещодавно повідомляють Khera et al. [6], використовуючи байєсівський підхід, що використовує понад 2 мільйони SNP. Дослідження або прогнозують стан ваги на момент збору даних (у поперечному перерізі) [6, 10], або поздовжньо прогнозують майбутній стан ваги [11, 12].
Асоціації, причини та тенденції надмірної ваги та ожиріння різняться між країнами, і, як правило, найбільш західні країни мають найвищу поширеність [13]. Тому ми мали на меті визначити частку надмірної ваги, яку можна пояснити відомими генетичними факторами батьків та факторами ризику розвитку ЛСД лише зі статусом ваги потомства у когорті Великобританії.
Матеріали і методи
Було проведено дослідження поперечного перерізу. Учасники повинні були бути біологічним батьком дитини у віці до 16 років, бути їх первинним опікуном, який народився і проживає в даний час у Великобританії, не мати жодних хронічних захворювань (за винятком надмірної ваги та ожиріння) і не дотримуватися ваги програма збитків. Розрахунок потужності для кількості змінних, включених в регресійний аналіз [14, 15], з очікуваним розміром середнього ефекту (f 2) 0,18, бажаним статистичним рівнем потужності 0,8, рівнем ймовірності 0,05 та 18 прогнозаторами дійшов висновку, що Потрібно було 127 учасників [15, 16]. Витрата 5% була врахована, намагаючись набрати 133 учасника. Всього було прийнято на роботу 130 батьків, 3 з яких відійшли до генетичного аналізу, а ще 4 не надали повних наборів даних і тому були виключені. Повні дані L&SD та SNP були зібрані для 123 батьків, в результаті чого потужність становила 0,78.
Антропометричні вимірювання для батьків та дітей
Дані батьків та потомства самостійно повідомляв один або обидва батьки. Зріст (м) і вага (кг) були зібрані для одного або обох батьків та потомства. Також була зібрана маса тіла матері до вагітності. ІМТ розраховували для матері (поточної та до вагітності) та/або батька (поточної), використовуючи рівняння: вага (кг)/зріст (м) 2 [1]. Дорослих учасників класифікували за нормальною та надмірною вагою на основі критеріїв Всесвітньої організації охорони здоров’я (ВООЗ) (≥25 кг/м 2) [1]. Процентил ваги у дитинстві розраховували за критеріями ВООЗ та UK90 [17, 18]. Дітей у віці 0-16 років класифікували на групи з нормальною вагою та надмірною вагою (діти віком 0-2 років ≥85-го процентиля, діти віком 2-16 років ≥98-го процентиля) [17, 18].
Батьківські змінні L&SD
Усі змінні були самостійно повідомлені батьком. Дані були зібрані за допомогою платформи Bristol Online Survey (https://www.onlinesurveys.ac.uk/). Наступні батьківські фактори ризику ЛЗС, використані у дослідженні Моранді та співавт. [7] оцінювались дихотомічно: стать (чоловік/жінка), неповне батьківство (так/ні) та статус куріння (так/ні). Наступні змінні були відібрані апріорі відповідно до їх асоціації із ожирінням у Великобританії [19]: статус домогосподарства (приватна власність), дохід (вище/нижче 32 000 фунтів стерлінгів - основна ставка податку 2016) [20], години сну на ніч (вище/нижче 7 год на ніч), чи здобута вища освіта (так/ні), чи є дитина на грудному вигодовуванні (так/ні), спосіб народження дитини (природне або кесарів розтин) та етнічна приналежність (кавказька чи ні).
Генетичний аналіз
Для остаточного включення були обрані такі SNP: похідний від мозку нейротрофічний фактор (BDNF) ген RS6265 (розміри ефекту для дорослих/дітей: 0,19/0,19), FTO rs9939609 (0,38/0,39), рецептор меланокортину 4 (MC4R) ген RS17782313 (0,07/0,13), трансмембранний білок 18 (TMEM18) ген RS2867125 (0,31/0,31) та серин/треонін-протеїнкіназа (TNN13K) ген RS1514175 (0,07/0,07).
Був проведений наступний процес відбору SNP: по-перше, SNP повинні були бути пов'язані з ожирінням у дитячому та зрілому віці незалежно від загальногеномних досліджень асоціацій із визначеним розміром ефекту (про які повідомлялося вище) [21-24]. Це мало забезпечити оцінку життєвого розвитку ожиріння. СНП виключали, якщо вони були пов’язані лише із ожирінням у зрілому віці чи в дитячому віці, але не з обома. Були включені ОНП з найбільшим визначеним розміром ефекту як для дитячого, так і для дорослого ожиріння. Всі вони також були віднесені до консорціуму GIANT як одні з найсильніших асоціацій із ожирінням [25]. Після цього з вибраних СНП дослідна група оцінила біологічну правдоподібність. Для затвердження біологічної правдоподібності SNP повинен був мати запропонований механізм, який свідчить про регулювання маси тіла. Наступні гени та SNP відповідали критеріям включення і тому були включені в це дослідження: BDNF RS6265 [26], FTO rs9939609 [27], MC4R rs17782313 [28], TMEM18 RS2867125 [29] та TNN13K rs1514175 [30]. Обсяг цього дослідження дозволив включити 5 найкращих ОНП після зазначеного вище процесу відбору.