Безкоштовна повнотекстова клональна еволюція клітин TP53 1G; gt; Мутація до і після неоад’юванту

Графічне представлення рівнів СА-125 упродовж захворювання/курсу лікування пацієнта з діагнозом HGSOC. Виділено два часові моменти, на D -LPS (до NACT) та на IDS (post NACT), у яких були зібрані зразки тканини крові та пухлини яєчників. СА-125: антиген раку 125; D -LPS: діагностична лапароскопія; NACT: неоад'ювантна хіміотерапія; IDS: хірургічне втручання з інтерваліруванням; HGSOC: високоякісний серозний рак яєчників.

безкоштовна

Графічне представлення VAF для SNV у TP53, ідентифікованих за допомогою NGS у зразках крові (референтних) та тканин пухлини, зібраних під час попередньої терапії (pre-NACT) на D-LPS та після терапії (post-NACT) у IDS, від пацієнта з HGSOC. (а) Гістограма показує зменшення VAF у зразках пухлини до (27,71%) та після NACT (4,21%), що вказує на поширеність алелю WT “C” (синя смужка) порівняно з алелем Alt “G” (жовтий бар) при IDS для TP53 c.215C> G (p.P72R) SNP, присутній при гетерозигозі (57,31%) у контрольній пробі крові; (b) Гістограма показує збільшення VAF у зразках пухлини до (50,13%) та після NACT (94,33%), що підкреслює поширеність алелю Alt "A" (червона смужка) порівняно з алелем WT "G" (зелена смужка ) у зразку тканини HGSOC, зібраному при IDS TP53 c.375 + 1G> Мутація, відсутня в еталонному зразку крові (лише алель WT “G”, зелена смужка). VAF: частота варіанта алелей; NACT: неоад'ювантна хіміотерапія; HGSOC: високоякісний серозний рак яєчників; D-LPS: діагностична лапароскопія; IDS: хірургічне втручання з інтервальним зняттям; Alt: альтернатива; WT: дикий тип.

Підтверджуючі електроферограми Сангера варіантів TP53, ідентифіковані NGS у пацієнта з HGSOC, у зразках пухлини, зібраних у D-LPS (pre-NACT) та в IDS (post-NACT), і в еталонному (зародковій лінії) зразку крові. (a) Результат секвенування в еталонній пробі крові, що показує поліморфізм TP53 c.215C> G при гетерозигозі (синій ящик) та алель WT “G” у положенні TP53 c.375 + 1G> G (чорний ящик); (b) Результат секвенування у зразку пухлини, зібраному на D-LPS (pre-NACT) поліморфізму TP53 c.215C> G (збільшений пік для алелю WT “C”, синій ящик) та мутації TP53 c.375 + 1G > A (гетерозигоз, червоний ящик), у транс-конфігурації; (c) Результат секвенування у зразку пухлини, зібраному в IDS (пост-НАКТ) поліморфізму TP53 c.215C> G, що вказує на гомозигоз алелю WT “C” або втрату алеля Alt “G” (синій ящик) та мутація TP53 c.375 + 1G> A, що вказує на гомозигоз мутаційного алелю Alt «A» або втрату алелю WT «G» (червоний ящик), у транс-конфігурації. HGSOC: високоякісний серозний рак яєчників; D-LPS: діагностична лапароскопія; IDS: хірургічне втручання з інтервальним зняттям; NACT: неоад'ювантна хіміотерапія; SNP: однонуклеотидний поліморфізм; NGS: послідовність наступного покоління; WT: дикий тип.

Репрезентативна модель подвійних SN53 ТР53 у транс-конфігурації, ідентифікована у зразку HGSOC до NACT/хіміотерапії на D-LPS, з розширенням клону та соматичним LOH у зразку пухлини після NACT, зібраному в IDS. У нормальних клітинах (Кров) на рівні зародкової лінії виявлено лише TP53 SNP c.215C> G; у зразку хемонаївного/необробленого (пухлина до NACT) мутація сплайсингу TP53 c.375 + 1G> A була присутня з незначним алелем Alt при переході на алель WT поліморфізму TP53 c.215C> G; у зразку після терапії/лікування (пухлина після NACT) спостерігалося повне розширення клону соматичним LOH із втратою незначного алелю Alt для TP53 c.215C> G SNP та втратою алелю WT для TP53 c.375 + 1G> Мутація. Аллельний алель мутації TP53 c.375 + 1G> A представлений червоним кольором, посилання WT - зеленим; Аллельний аллель поліморфізму TP53 c.215C> G забарвлений оранжевим кольором, контрольний алель WT - синім; незначні алелі Alt - малими літерами, алелі WT - великими літерами. VAF: частота варіанта алелей; NACT: неоад'ювантна хіміотерапія; HGSOC: високоякісний серозний рак яєчників; D-LPS: діагностична лапароскопія; IDS: хірургічне втручання з інтервальним зняттям; Alt: альтернатива; WT: дикого типу; LOH: втрата гетерозиготності.