Безкоштовний повнотекстовий взаємодія клітин-ВІЛ-1 Інтерактоме Пошуки нової терапевтичної інтервенції HTML
Схематичний огляд циклу реплікації ВІЛ-1: (1) Частинка ВІЛ-1 прикріплюється і зливається з клітинною мембраною господаря через її поверхневі глікопротеїни і потрапляє в клітинну цитоплазму; (2) вірусна геномна РНК зворотно транскрибується в ДНК, що супроводжується розкриттям вірусного капсиду; (3) ядерний вхід до інтеграційного комплексу відбувається за допомогою різних ядерних білків-господарів; (4) інтеграція vDNA в хроматин-хазяїн; (5) під час продуктивної інфекції відбувається транскрипція вірусу; (6) відбувається сплайсинг РНК та ядерний експорт вірусної РНК; (7) виробництво та складання нових частинок вірусу, які виходять з плазматичної мембрани; та (8) віріони стають інфекційними після дозрівання (дії протеази). Вірусні та клітинні білки-господарі, що беруть участь у циклі реплікації ВІЛ-1, виділяються на кожному етапі червоним та чорним кольорами відповідно.

Схематичне зображення місць дії (а) клінічних інгібіторів ВІЛ-1 (АРТ) та (б) факторів рестрикції господаря, яким протидіють допоміжні білки ВІЛ-1. Абревіатури: APOBEC3G - фермент для редагування мРНК аполіпопротеїну B, каталітичний поліпептид-подібний 3G, TRIM5α - білок, що містить трипартійний мотив, 5α-ізоформа, SAMHD1 - домен SAM та білок, що містить домен HD, MX2 - стійкість до міксовірусу людини 2, Vif - вірусна інфекція фактор, Vpu — вірусний білок U.
Структурна організація нуклеопоринів в NPC: Нупи організовані в різні підкомплекси, які тут показані в різнокольорових коробках. Розташування Nups позначено в лівій половині рамки NPC - зелений відображається центральний транспортний канал/підкомплекс Nup62; кільце перехідника/внутрішнє кільце виконано цегляно-червоним кольором; трансмембранні Nups мають фіолетовий колір; Y-комплекси показані помаранчевим кольором; цитоплазматичне кільце Нупи мають рожевий колір; Грудки, що утворюють цитоплазматичні нитки, мають світло-блакитний колір; ядерний кошик зображений у бірюзовий колір. Червоні виділені нупи - це ті, які визначені найважливішими під час зараження ВІЛ-1. FG-Nups підкреслено.
Основні події, що відбуваються під час ядерного імпорту та експорту ВІЛ-1: (а) Ядерний імпорт ВІЛ-1 PIC: CPSF6 взаємодіє з неушкодженим ядром ВІЛ, який при нанесенні покриття та зворотній транскрипції формує PIC. TNPO3, CypA та CypA-подібний домен Nup358 пов'язується ліворуч над CA і допомагає стикувати PIC на цитоплазматичній поверхні NPC; в той час як Vpr та IN мають NLS, взаємодіють з Nups, такими як Nup153, які допомагають імпортувати PIC в ядро. У нуклеоплазмі LEDGF бере участь у вивільненні PIC з Nup153 і допомагає в інтеграції vDNA в ДНК господаря; (b) ядерний експорт vRNA-білкового комплексу: неспіліфікована та частково сплайсирована mRNA потребує вірусного допоміжного білка Rev, який взаємодіє з різними клітинними факторами, такими як Crm1, eIF-5A та Nups, такими як Nup62, Nup214, Nup98 та сприяє ядерному експорту цей вірусний рибонуклеопротеїновий комплекс. Абревіатури: NPC - комплекс ядерних пор, CPSF6 - специфічний фактор розщеплення та поліаденилування 6, TNPO3 - транспортін 3, CypA - циклофілін, CA - капсид, Vpr - вірусний білок r, IN - інтеграза, RT - зворотна транскриптаза, PIC - комплекс попереднього ініціювання, LEDGF - похідний з кришталика фактор росту, IN - інтеграза, Crm1 - підтримка хромосомної області - 1, Rev - регулятор експресії віріону, eIF-5A - фактор ініціації трансляції еукаріотичної системи - 5A.