Докази змін у установці оптимального перекладу перекладу eIF4B, eIF4F та
Анотація
Ініціювання синтезу еукаріотичного білка вимагає численних факторів, щоб правильно зв’язати і розташувати мРНК на рибосомі 40S. Перш ніж взаємодіяти рибосома 40S і мРНК, група факторів ініціації еукаріотичного фактора ініціювання 4 (eIF4), eIF4A, eIF4B та eIF4F, функціонує в АТФ-залежному розмотуванні вторинної структури в 5 'нетранслируемой області (UTR) мРНК (для огляду див. Dever, 2002; Mathews, 2002; Sonenberg and Dever, 2003; Pestova et al., 2007; Gallie, 2007). eIF4A, одиничний поліпептид (приблизно 50 кД), є прототипом DEAD/H гелікази та має мотиви зв'язування АТФ та гелікази (для огляду див. Rogers et al., 2002). eIF4B - це РНК-зв’язуючий білок (приблизно 59 кД), який функціонує для посилення геліказної активності eIF4A та eIF4F (Bi et al., 2000; Rogers et al., 2001). Комплекс, що зв’язує кришку, eIF4F, складається з двох субодиниць, eIF4E (приблизно 24 кД) і eIF4G (приблизно 200 кД). eIF4E є білком, що зв'язує шапку, і eIF4G взаємодіє з кількома компонентами поступальної машини, включаючи eIF3, eIF4A та полі (А) зв'язуючий білок (PABP; для огляду див. Prévôt et al., 2003). Рослини мають другу форму eIF4F, eIF (iso) 4F, яка має подібну активність до eIF4F, але складається з генетично відмінних субодиниць eIF (iso) 4G (приблизно 86 кД) та eIF (iso) 4E (приблизно 24 кД; Браунінг, 1996).
eIF4B був виділений із ретикулоцитів кроликів (Trachsel et al., 1977; Benne and Hershey, 1978), дріжджів (Saccharomyces cerevisiae; Altmann et al., 1993; Coppolecchia et al., 1993), Drosophila melanogaster (Hernandez et al., 2004) та рослин (Browning et al., 1989; Metz et al., 1999). Він стимулює трансляцію мРНК, гідроліз АТФ та розмотувальну активність eIF4F та eIF4A (Grifo et al., 1983, 1984; Ray et al., 1985; Abramson et al., 1987, 1988a, 1988b; Browning et al., 1989; Rozen et al., 1990; Lorsch and Herschlag, 1998; Bi et al., 2000; Rogers, et al., 2001; Khan and Goss, 2005). eIF4B також відіграє роль у опосередкованому трансляції пікорнавірусної внутрішньої рибосоми (Meyer et al., 1995; Ochs et al., 1999, 2002; Rust et al., 1999), припиненні трансляції мРНК-господаря простого герпесу (Doepker та ін., 2004), та відновлення поліцистронної РНК вірусу мозаїки цвітної капусти (Park et al., 2004). eIF4B є мішенню для деградації під час апоптозу (Bushell et al., 2000). Такі звіти свідчать про важливу роль eIF4B у ініціюванні перекладу. Однак порушення єдиного гена дріжджів eIF4B не є смертельним. Це призводить до фенотипу, чутливого до холоду і повільно зростаючого (Altmann et al., 1993; Coppolecchia et al., 1993). Подібним чином, пригнічення РНК-інтерференції одного гена дрозофіли eIF4B свідчить про те, що eIF4B необхідний під час голодування, але не є важливим для виживання в оптимальних умовах (Hernandez et al., 2004). На відміну від інших факторів ініціювання, eIF4B погано зберігається у рослин, тварин та грибів на рівні амінокислотної послідовності. Таким чином, eIF4B, швидше за все, зберігається на рівні структури та/або функції.
Регіон, відповідальний за димеризацію in vitro пшениці з зв'язуванням eIF4B та РНК, розташований у кінці С білка і з'єднує два тандемних місця взаємодії eIF4A та PABP (Cheng et al., 2008). Часткова димеризація пшениці eIF4B in vitro стимулюється у присутності цинку (Cheng et al., 2008).