Дослідники проводять перші рентгенівські вимірювання на основній протеазі SARS-CoV-2; Новини-Медичні
Група дослідників з Національної лабораторії Департаменту енергетики Оук-Ридж та Аргонна провела перші рентгенологічні вимірювання кімнатної температури на основній протеазі SARS-CoV-2 - ферменті, який дозволяє вірусу розмножуватися.
Рентгенологічні вимірювання означають важливий перший крок у кінцевій меті дослідників - побудувати комплексну 3D-модель ферментативного білка.
Модель буде використана для просування суперкомп'ютерних моделювань, спрямованих на пошук інгібіторів лікарських засобів, що блокують механізм реплікації вірусу та допомагають припинити пандемію COVID-19. Результати їхніх досліджень є загальнодоступними та опубліковані в журналі Nature Communications.
ГРВІ-CoV-2 - це вірус, який викликає захворювання COVID-19. Вірус розмножується, експресуючи довгі ланцюги білків, які фермент протеази повинен розрізати на менші відрізки.
Протеаза незамінна для життєвого циклу вірусу. Білок за формою нагадує серце Валентина, але насправді це серце вірусу, яке дозволяє йому розмножуватися і поширюватися. Якщо ви пригнічуєте протеазу і зупиняєте серце, вірус не може виробляти білки, необхідні для його реплікації. Ось чому протеаза вважається такою важливою мішенню для наркотиків ".
Андрій Ковалевський, автор-кореспондент, DOE/Oak Ridge National Laboratory
Хоча структура відома з криогенно збережених кристалів, "це перший раз, коли структуру цього ферменту вимірювали при кімнатній температурі, що є значним, оскільки вона знаходиться поблизу фізіологічної температури, де працюють клітини".
Побудова повної моделі структури білка вимагає виявлення кожного елемента в структурі та способу їх розташування. Рентген ідеально підходить для виявлення важких елементів, таких як атоми вуглецю, азоту та кисню.
Через інтенсивність променів рентгенівського випромінювання на більшості великомасштабних синхротронних установок біологічні зразки, як правило, повинні бути кріогенно заморожені приблизно до 100 К, або приблизно до мінус 280 градусів за Фаренгейтом, щоб витримати випромінювання досить довго для збору даних.