Дослідження асоціації трьох генних поліморфізмів, нещодавно визначених асоціацією, що розширює геном

Інститут здоров'я дітей та підлітків, кафедра здоров'я дітей, підлітків та жінок

трьох

Школа громадського здоров'я, Пекінський університет

No38 Xueyuan Road, район Хайдянь, 100191 Пекін, Китай

Статті, пов’язані з "

  • Facebook
  • Twitter
  • LinkedIn
  • Електронна пошта

Анотація

Завдання: Це дослідження мало на меті вивчити асоціації трьох однонуклеотидних поліморфізмів (ОНП) із фенотипами, пов’язаними з ожирінням, у китайських дітей. Ці ОНП були виявлені нещодавнім дослідженням, проведеним серед усіх європейських дітей серед усіх геномів (GWA). Враховуючи, що різноманітні генетичні особливості різної етнічної приналежності можуть спричинити різні асоціації, необхідно вивчати ці асоціації в різних етнічних групах населення. Методи: Всього в дослідження було включено 3922 дітей, у тому числі 2191 нормальної ваги, 873 дітей із надмірною вагою та 858 дітей із ожирінням. Були проведені логістичні та лінійні регресії, а також метааналіз для оцінки зв'язків між ОНП та фенотипами, пов'язаними з ожирінням. Результати: Об'єднані коефіцієнти шансів A-алелю rs564343 в PACS1 для ожиріння та важкого ожиріння становили 1,180 (p = 0,03) та 1,312 (p = 0,004) відповідно. Ми також виявили, що rs564343 номінально асоціювався з ІМТ, показником стандартного відхилення ІМТ (BMI-SDS), обхватом талії та співвідношенням талії та висоти (p

Вступ

Широко визнано, що ожиріння стає все більш важливою проблемою охорони здоров'я як у розвинутих, так і в країнах, що розвиваються. Систематичний аналіз нещодавно повідомив, що загальна поширеність надмірної ваги та ожиріння за останні три десятиліття зросла на 27,5% серед дорослих та 47,1% серед дітей [1]. У США понад 2/3 (68,5%) дорослих та майже одна третина (31,8%) молоді мали або надмірну вагу, або ожиріння у 2011-2012 рр. [2]. У Китаї поширеність надмірної ваги та ожиріння серед міських хлопчиків та дівчаток становила 28,14% та 15,56%, а серед сільських хлопчиків та дівчаток - 18,62% та 11,81% у 2010 р., Що свідчить про зростання порівняно з даними 2005 р. [3]. Ожиріння є важливим фактором ризику багатьох захворювань, включаючи цукровий діабет 2 типу, гіперліпідемію, гіпертонію, серцево-судинні захворювання та рак [4,5].

Генетичні фактори відіграють незамінну роль у схильності людини до ожиріння [6,7,8]. Спадковість дисперсії ВМІ коливалась від 30% до 70% [9], і за оцінками спадковість від ІМТ або ожиріння вища у дітей, ніж у дорослих [10]. В останні роки дослідження геномних асоціацій (GWA) надали докази генетичних локусів ризику ожиріння [11,12,13,14]. Багато досліджень реплікації цих локусів було проведено в багатьох етнічних групах населення, включаючи китайців [15,16,17,18,19,20]. Два нещодавно опубліковані дослідження Ванга та співавт. [19] та Meng та співавт. [20] з нашої дослідницької групи підтвердили, що деякі локуси, визначені дослідженнями GWA, пов’язані з ожирінням у китайських дітей, та визначили етнічну різницю в розмірі ефекту для деяких локусів (додаткова таблиця 1, доступна на http://content.karger.com/ProdukteDB/produkte.asp?doi=471487).

Нещодавнє дослідження GWA виявило чотири нових локуси (rs564343 у фосфофуриновому кислотному кластері, що сортує білок 1 (PACS1), rs11109072 у транскрипті, пов’язаному з рабдоміосаркомою 2 (RMST), rs1957894 у протеїнкіназі С ета (ПРКЧ) і rs11208659 у рецепторі лептину (LEPR)), які були пов’язані з важким ожирінням серед європейських дітей на ранніх стадіях [21]. Наскільки нам відомо, ці нові локуси не вивчались у незалежних популяцій з різною етнічною приналежністю. Враховуючи, що різноманітні генетичні особливості різної етнічної приналежності можуть спричинити різні асоціації, необхідно вивчати ці асоціації в різних етнічних групах населення. Тому ми провели дане дослідження для 3 локусів (PACS1, RMST, PRKCH) з незначною частотою алелів ≥0,20 на основі обсягу нашої вибірки, щоб дослідити, чи пов’язані ці локуси із ожирінням у китайських дітей.

Предмети та методи

Предмети

Ми провели три незалежних дослідження із загальною кількістю 3922 суб'єктів віком 6-18 років, набраних з міських районів Пекіна, Китай. У першому дослідженні ліпідів підліткового віку, резистентності до інсуліну та генів-кандидатів (ALIR) взяли участь 937 учасників з 9 середніх шкіл району Дунчен у Пекіні. Друге дослідження було проведено в рамках Проекту всебічної профілактики підлітків із надмірною вагою та ожирінням (CPOOA) з фізичними вправами та здоровим харчуванням як інструментами, яке було проведено в 3 середніх школах та 2 початкових школах району Хайдянь Пекіна, залучивши 1093 учасника. Обидва дослідження є дослідженнями випадків та контролю, а стратегії встановлення та інша детальна інформація були описані раніше [22,23].

Письмова інформована згода була надана всіма учасниками та їх батьками, якщо йдеться про неповнолітніх. Перше та друге дослідження були схвалені Етичним комітетом Наукового центру охорони здоров’я Пекінського університету, тоді як третє дослідження було схвалено Етичним комітетом Китайського центру контролю та профілактики захворювань.

Антропометричні, біохімічні та вимірювання артеріального тиску

Всі вимірювання у трьох дослідженнях проводили однаковими методами. Антропометричні вимірювання, включаючи зріст, вагу, обхват талії та стегон, проводили згідно із стандартними протоколами [30]. Розраховували ІМТ (кг/м 2) та показник стандартного відхилення статі та віку ІМТ (BMI-SDS). Останній розраховували згідно з референтними даними про зростання Світової організації охорони здоров’я для дітей у віці 5-19 років [31]. Зразки венозної крові натще приймали для вимірювання загального холестерину, тригліцеридів, холестерину ліпопротеїдів низької щільності (LDL-C), холестерину ліпопротеїдів високої щільності (HDL-C) та глюкози плазми за допомогою біохімічного автоаналізатора (ALIR та CPOOA: Hitachi7060, Токіо, Японія; SCICO: Olympus AU400, Токіо, Японія). Артеріальний тиск вимірювали за допомогою аускультаційного ртутного сфігмоманометра з відповідним розміром манжети для дітей у цих дослідженнях, згідно з рекомендацією Національної робочої групи з питань підвищення рівня артеріального тиску у дітей та підлітків [32]. Середній систолічний та діастолічний артеріальний тиск (SBP та DBP) обчислювали шляхом усереднення трьох вимірювань.

Відбір і генотипування SNP

Враховуючи розмір вибірки (2191 дитина з нормальною вагою та 858 дітей з ожирінням), і передбачуваний розмір ефекту 1,2 для частоти алелів ≥ 0,20, потужність виявлення позитивної асоціації, за оцінками, становила 75%. Отже, ми вибрали три SNP (rs564343, rs11109072 та rs1957894) з незначною частотою алелів ≥ 0,20 у популяції Китаю (база даних Hapmap: http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov), за винятком rs11208659 в LEPR (незначна частота алелів = 0,07). Проекти мультиплексних аналізів SNP не вдалися для одного SNP (rs1957894 в ПРКЧ), тому ми замінили його одним проксі SNP (rs1957893), що має сильну нерівновагу зв’язку (r 2 = 1,00) у населення Китаю у випуску даних HapMap 24/Phase II Nov08 (http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov).