HsaA - флавінзалежна монооксигеназа, субодиниця оксигенази HsaA - мікобактерії туберкульозу (штам

Оцінка анотацій: 5 із 5

Оцінка анотацій забезпечує евристичний показник вмісту анотації запису UniProtKB або протеома. Цей рахунок не може використовувати як міру точності анотації, оскільки ми не можемо визначити „правильну анотацію” для будь-якого даного білка.

- Експериментальні дані на рівні білка i

Це вказує на тип доказів, що підтверджують існування білка. Зауважте, що докази „існування білка” не дають інформації про точність або правильність відображених послідовностей.

Виберіть розділ ліворуч, щоб переглянути вміст.

Цей розділ містить будь-яку корисну інформацію про білок, переважно біологічні знання.

Інформація, вироблена вручну, для якої є опубліковані експериментальні дані.

Твердження вручну на основі експерименту в i

Різне

Цей підрозділ розділу Функція описує каталітичну активність ферменту, тобто хімічну реакцію, яку фермент каталізує.

Каталітична активність i

Твердження вручну на основі експерименту в i

Цей підрозділ розділу "Функція" описує біофізичні та хімічні властивості, такі як максимальне поглинання, кінетичні параметри, залежність рН, окислювально-відновний потенціал та температурна залежність.

KM = 97 мкМ для 3-HSA (з FAD при pH 7 і при 25 градусах Цельсія) 1 Публікація

Твердження вручну на основі експерименту в i

Цей підрозділ розділу „Функція” описує метаболічні шляхи, пов’язані з білком.

Шлях i: біосинтез стероїдів

Сайти

Цей підрозділ розділу Функція описує взаємодію між однією амінокислотою та іншою хімічною сутністю. Пріоритет віддається анотації фізіологічних лігандів.

Регіони

Цей підрозділ розділу "Функція" описує область білка, яка зв'язує нуклеотидні фосфати. Він завжди включає більше однієї амінокислоти і включає всі залишки, що беруть участь у зв’язуванні нуклеотидів.

Проект генної онтології (GO) забезпечує набір ієрархічно керованої лексики, розділеної на 3 категорії:

GO - Молекулярна функція i

Активність 3-гідрокси-9,10-секоандроста-1,3,5 (10) -трієн-9,17-діонмонооксигенази Джерело: UniProtKB-EC
зв'язування флавіну аденіндинуклеотиду Джерело: UniProtKB

Висновок з прямого аналізу

Використовується для позначення прямого аналізу функції, процесу або компонента, позначеного терміном GO.

Більше інформації в посібнику з коду доказів GO

Висновок з прямого аналізу i

GO - Біологічний процес i

катаболічний процес ароматичної сполуки Джерело: UniProtKB-KW

катаболічний процес холестерину Джерело: MTBBASE Висновок із прямого аналізу i

Висновок з мутантного фенотипу

Описує анотації, які зроблені на підставі вивчення варіацій або змін у генному продукті, таких як мутації або аномальні рівні, та включає такі методи, як нокаути, надмірна експресія, експерименти проти сенсу та використання специфічних інгібіторів білка.

Більше інформації в посібнику з коду доказів GO

Виведено з мутантного фенотипу i

Ключові слова UniProtKB складають контрольований словник з ієрархічною структурою. Ключові слова узагальнюють зміст запису UniProtKB та полегшують пошук цікавих білків.

Молекулярна функція	Монооксигеназа, оксидоредуктаза
Біологічний процес	Катаболізм ароматичних вуглеводнів, деградація ліпідів, метаболізм ліпідів, метаболізм стероїдів
Ліганд	FAD, Флавопротеїн, FMN

Бази даних ферментів та шляхів

Збірник баз даних про шляхи/геном BioCyc

UniPathway: ресурс для дослідження та анотації метаболічних шляхів

Бази даних хімії

SwissLipids - ресурс знань з біології ліпідів

Цей розділ містить інформацію про назви білка та гена та синонім (и) та про організм, що є джерелом білкової послідовності.

Імена та таксономія i

Цей підрозділ розділу "Назви та систематика" містить вичерпний перелік усіх назв білка, від загальновживаних до застарілих, що дозволяє однозначно ідентифікувати білок.

Твердження вручну на основі експерименту в i

Цей підрозділ розділу "Імена та таксономія" вказує на ім'я (і) гена (генів), що кодує послідовність (і) білка, описану у цій статті. Існують чотири різні маркери: 'Ім'я', 'Синоніми', 'Впорядковані імена локусів' та 'Імена ORF'.

Інформація, вироблена вручну, заснована на висловлюваннях у наукових статтях, для яких немає експериментальної підтримки.

Ручне твердження на основі думки в i

Цей підрозділ розділу "Імена та систематика" містить інформацію про назви (імена) організму, що є джерелом білкової послідовності.

Цей підрозділ розділу Імена та таксономія показує унікальний ідентифікатор, присвоєний NCBI вихідному організму білка. Це називається `` таксономічним ідентифікатором '' або `` таксисом ''.

Цей підрозділ розділу "Імена та систематика" містить таксономічну ієрархічну класифікаційну лінію вихідного організму. У ньому перелічуються вузли, як вони з’являються зверху вниз у таксономічному дереві, а спочатку перелічується більш загальна група.

Цей підрозділ розділу Імена та таксономія присутній для записів, які є частиною протеома, тобто набору білків, які, як вважається, експресуються організмами, геноми яких були повністю секвендовані.

Протеом UniProt може складатися з декількох компонентів.
Назва компонента відноситься до геномного компонента, що кодує набір білків.

Бази даних про організм

База даних геному мікобактерій туберкульозу H37Rv

Цей розділ містить інформацію про розташування та топологію зрілого білка в клітині.

Субклітинне розташування i

GO - Клітинний компонент i

Цей розділ описує посттрансляційні модифікації (PTM) та/або події обробки.

PTM/обробка i

Обробка молекули

Цей підрозділ розділу "PTM/обробка" описує ступінь поліпептидного ланцюга у зрілому білку після обробки або протеолітичного розщеплення.

Протеомічні бази даних

PaxDb, база даних про середню кількість білків у всіх трьох сферах життя

Цей розділ містить інформацію про експресію гена на рівні мРНК або білка в клітинах або тканинах багатоклітинних організмів.

Цей підрозділ розділу "Вираження" повідомляє про експериментально доведений вплив індукторів та репресорів (зазвичай хімічних сполук або факторів навколишнього середовища) на рівень експресії білка (або мРНК) (регуляція вгору, зниження регуляції, конститутивна експресія).