Низька кількість копій гена амілази слини схильна до ожиріння Nature Genetics
Предмети
Анотація
Поширені варіанти багатоаллельних копій (CNV), здається, збагачені для фенотипових асоціацій порівняно з їх двобічними аналогами 1,2,3,4. Тут ми досліджували вплив ефекту дозування гена на ожиріння шляхом дослідження асоціації CNV щодо рівня експресії генів у жировій тканині. Ми виявили значну асоціацію багатоалельного CNV, що охоплює ген амілази слини (AMY1) з індексом маси тіла (ІМТ) та ожирінням, і ми повторили цю знахідку у 6200 суб’єктів. Збільшена AMY1 номер копії позитивно асоціювався з експресією гена амілази ( = 2,31 × 10 −14) і рівні ферментів у сироватці крові ( -16), тоді як зменшений AMY1 кількість копій була пов'язана зі збільшенням ІМТ (зміна ІМТ на розрахункову копію = -0,15 (0,02) кг/м 2; = 6,93 × 10 −10) та ризик ожиріння (коефіцієнт шансів (АБО) на розрахункову копію = 1,19, 95% довірчий інтервал (ДІ) = 1,13–1,26; = 1,46 × 10 −10). Значення АБО 1,19 на копію AMY1 перетворюється на приблизно восьмикратну різницю в ризику ожиріння між предметами зверху (номер копії> 9) та знизу (номер копії)
Параметри доступу
Підпишіться на журнал
Отримайте повний доступ до журналу протягом 1 року
лише 4,60 € за випуск
Усі ціни вказані у нетто-цінах.
ПДВ буде додано пізніше під час оплати.
Оренда або купівля статті
Отримайте обмежений за часом або повний доступ до статей на ReadCube.
Усі ціни вказані у нетто-цінах.
Коди приєднання
Первинні приєднання
Онібус експресії генів
Список літератури
Гонсалес, Е. та ін. Вплив CCL3L1 ген-містять сегментарне дублювання сприйнятливості до ВІЛ-1/СНІДу. Наука 307, 1434–1440 (2005).
Hollox, E.J. та ін. Псоріаз пов’язаний із збільшенням кількості геномних копій β-дефензину. Нат. Genet. 40, 23–25 (2008).
Феллерманн, К. та співавт. Поліморфізм кластерного гена хромосоми 8 з низьким числом копій гена β-дефензину 2 схильний до хвороби Крона товстої кишки. Am. Дж. Хам. Genet. 79, 439–448 (2006).
Айтман, Т.Дж. та ін. Скопіюйте поліморфізм чисел у Fcgr3 схильний до гломерулонефриту у щурів та людей. Природа 439, 851–855 (2006).
Eleftherohorinou, H. et al. famCNV: асоціація варіантів кількості копій для кількісних ознак у сім'ях. Біоінформатика 27, 1873–1875 (2011).
Уоллі, А. та ін. Диференціальний аналіз коекспресії мереж, пов'язаних із ожирінням, у підшкірній жировій клітковині людини. Міжнародний Дж. Обес. (Лонд.) 36, 137–147 (2012).
Гісі, П.Г. та ін. Дослідження асоціації для короткозорості та рефракційної помилки в усьому геномі визначає локус сприйнятливості при 15q25. Нат. Genet. 42, 902–905 (2010).
Польовий, С.Ф. та ін. Експериментальні аспекти аналізів варіантів номерів копій на CCL3L1. Нат. Мед. 15, 1115–1117 (2009).
Hollox, E.J. в Геномні структурні варіанти Вип. 838 (ред. Фейк, Л.) 187–207 (Springer New York, 2012).
Олдхоус, М.К. та ін. Методи вимірювання та точність варіації числа копій: неможливість відтворити асоціації числа копії β-дефензину з хворобою Крона. Гул. Мол. Genet. 19, 4930–4938 (2010).
Карпентер, Д., Уокер, С., Прескотт, Н., Шалквейк, J. & Armor, J.A. Точність та диференціальне упередження при вимірюванні числа копій CCL3L1 у поєднанні досліджень з трьома аутоімунними розладами. BMC Genomics 12, 418 (2011).
Садмант, П.Х. та ін. Різноманітність генів варіації чисельності копій людини та мультикопіювання генів. Наука 330, 641–646 (2010).
Балкау, Б., Ешвеге, Е., Тише, Дж. І Марре, М. Запропоновані критерії діагностики діабету: дані французького епідеміологічного дослідження (D.E.S.I.R.). Діабет Метаб. 23, 428–434 (1997).
Спектор, Т.Д. & Вільямс, Ф.М. Британський реєстр для дорослих близнюків (TwinsUK). Двомісний Res. Гул. Genet. 9, 899–906 (2006).
Meyre, D. та ін. Загальногрупове дослідження асоціації щодо раннього та патологічного ожиріння дорослих визначає три нових локуси ризику серед європейських популяцій. Нат. Genet. 41, 157–159 (2009).
Отже, H.C., Gui, A.H., Cherny, S.S. & Sham, P.C. Оцінка спадковості пояснюється відомими варіантами сприйнятливості: опитування десяти складних захворювань. Genet. Епідеміол. 35, 310–317 (2011).
Maes, H.H., Neale, M.C. & Eaves, L.J. Генетичні та екологічні фактори відносної маси тіла та ожиріння людини. Поводитись. Genet. 27, 325–351 (1997).
Stunkard, A.J., Foch, T.T. & Hrubec, Z. Двійне дослідження людського ожиріння. J. Am. Мед. Доц. 256, 51–54 (1986).
Вен, В. та ін. Мета-аналіз визначає загальні варіанти, пов'язані з індексом маси тіла у східних азіатів. Нат. Genet. 44, 307–311 (2012).
Перрі, Г.Х. та ін. Дієта та еволюція зміни кількості копій гена амілази людини. Нат. Genet. 39, 1256–1260 (2007).
Чаттертон, Р.Т. Молодший, Фогельсонг, К.М., Лу, Ю.К., Еллман, А.Б. & Hudgens, G.A. Слинна α-амілаза як міра ендогенної адренергічної активності. Клін. Фізіол. 16, 433–448 (1996).
Парк, К.С. Спадковість активності амілази сечі та плазми. Джинруї Іденгаку Зассі 22, 79–88 (1977).
Marques-Bonet, T. et al. Всплеск сегментарних копій в геномі африканського пращура мавп. Природа 457, 877–881 (2009).
Сквайерс, Б.Т. Секреція амілази слини людини у відношенні до дієти. J. Physiol. (Лонд.) 119, 153–156 (1953).
Міффлін, Т.Є., Хортін, Г. і Брунс, Д.Є. Електрофоретичні аналізи ізоферментів та ізоформ амілази. Клін. Лабораторія. Мед. 6, 583–599 (1986).
Мірський, А. Метаболізм жирової тканини в пробірці. Біохім. J. 36, 232–241 (1942).
Бінгем, С.А. та ін. Харчові методи в Європейському проспективному дослідженні раку в Норфолку. Здоров'я Nutr. 4, 847–858 (2001).
Kondo, T., Hayakawa, T., Shibata, T., Sato, Y. & Toda, Y. Сироваткові рівні панкреатичних ферментів у худих та ожирілих суб'єктів. Міжнародний J. Панкреатол. 3, 241–248 (1988).
Schneeman, B.O., Inman, M.D. & Stern, J.S. Активність ферментів підшлункової залози у щурів Цукера із ожирінням та худими: дослідження розвитку. Дж. Нутр. 113, 921–925 (1983).