Спрощений детектор руху на мікрохвильовій основі для моніторингу активності клітини в домашніх умовах у мишей

Андреас Геневський

1 Інститут психіатрії імені Макса Планка, каф. Стресова нейробіологія та нейрогенетика, RG Neuronal Plasticity, Kraepelinstr. 2-10, Мюнхен, D-80804 Німеччина

Даніель Е. Хайнц

2 магістерська програма з нейронауки, Міждисциплінарний центр нейронаук (IZN), Університет Гейдельберга, Im Neuenheimer Feld 504, Гейдельберг, D-69120 Німеччина

Пол М. Каплік

3 Кафедра психіатрії та психотерапії, Університет Людвіга-Максиміліана, Нусбаумштрассе 7, Мюнхен, D-80336 Німеччина

4 Університет Фрезеніуса, Infanteriestraße 11a, Мюнхен, D-80797 Німеччина

Касьока Кілонцо

5 Інститут прикладної фізіології Ульмського університету, Альберт-Ейнштейн-Алле 11, N26/4406, Ульм, D-89081 Німеччина

Карстен Т. Вотяк

Пов’язані дані

Усі конструкторські файли та оригінальні дані, які використовувались для підготовки рисунків, доступні в Інтернеті [25] або за запитом.

Анотація

Передумови

Рухома активність гризунів є важливим показником для оцінки самопочуття та фізичного здоров’я та є ключовою для поведінкового фенотипування. Вимірювати активність домашньої клітини стандартними та економічно ефективними оптичними методами у мишей стало складно, оскільки сучасні умови утримання (наприклад, індивідуально провітрювані клітини, збагачення клітини) не дозволяють постійного, безперешкодного, візуального доступу. Вирішення цього питання або вимагає більших інвестицій, особливо якщо паралельно проводитиметься кілька експериментів, або за рахунок тварин. Мета цього дослідження полягає у наданні простого, але задовольняючого рішення для поведінкового біолога на рівні початківців.

Результати

Ми демонструємо конструкцію, конструкцію та перевірку спрощеного, недорогого, радіолокаційного детектора руху для моніторингу активності клітини в домашніх умовах у мишей. Крім того, ми демонструємо, що миші, яких селекційно виводили з низьким рівнем поведінки, пов'язаної з тривогою (LAB), мають дефіцит у циркадному фототренуванні порівняно з контрольними тваринами CD1.

Висновок

У цьому дослідженні ми продемонстрували, що запропонований нами недорогий мікрохвильовий детектор руху добре підходить для дослідження циркадних ритмів у мишей.

Електронний додатковий матеріал

Інтернет-версія цієї статті (doi: 10.1186/s13036-017-0079-y) містить додаткові матеріали, доступні для авторизованих користувачів.

Передумови

Дизайн та виготовлення друкованих плат

Друковані плати (друковані плати) були розроблені з використанням міжплатформенного набору електронних засобів автоматизації проектування з відкритим кодом KiCAD [24]. Усі дизайнерські файли доступні в Інтернеті [25] або за запитом. Друковані плати були виготовлені громадською службою друкованих плат OSH Park [26] із використанням стандартних виробничих параметрів: двошаровий FR4, товщина 1,6 мм, безелектричне нікелеве занурення в золото, кліренс> 160 мкм, ширина сліду> 160 мкм,> Розмір свердла 254 мкм. Однак друкована плата досить проста (наприклад, розбіжними ємностями можна в основному знехтувати), і рішення "зроби сам" із використанням попередньо чутливих друкованих плат, впливу ультрафіолетових променів, фіксації та травлення, таких як хлорид заліза (III) або перекис водню/соляна кислота, дає дуже хороші результати. Для цілої збірки з використанням перфборда, ймовірно, потрібні дротові компоненти, а не поверхневі пристрої (SMD).

Розробка програмного забезпечення

Міжплатформене програмне забезпечення для написання та завантаження коду Arduino (див. Лістинг 1, [Додатковий файл 1]) є у вільному доступі в Інтернеті [27]. Усі файли (включаючи вихідні дані, використані для цієї публікації) доступні в Інтернеті [25] або за запитом. Сценарій аналізу Python (див. Лістинг 2) [Додатковий файл 1] написаний за допомогою Anaconda Python 3.5 [28]. Перенести цей сценарій на Octave, MATLAB або C ++ можливо лише з невеликими зусиллями.

Статистичний аналіз

Усі дані представлені як середні значення ± стандартна помилка. Статистичний аналіз проводили за допомогою GraphPad Prism 5.03. Односторонній та двосторонній дисперсійний аналіз супроводжувався тестом множинного порівняння Даннета або пост-хок-аналізом Бонферроні. Коефіцієнти кореляції Пірсона визначали за допомогою функції Scipy pearsonr (), що включає модуль статистики.

Результати

Принцип роботи та конструкція схеми

Принцип роботи системи виявлення активності в клітці будинку. Рухи маленької тварини модулюють і відображають випромінювані 10,525 ГГц радіолокаційні хвилі через доплерівський зсув. Це відхилення від частоти випромінювання визначається детектором руху X-Band, і внутрішня схема генерує сигнали логіки + 5 В відповідно до швидкості руху тварин. Ці множинні імпульси короткої та змінної тривалості перетворюються екраном детектора руху на повторно випробовувані імпульси> 1 с і дозволяють платі мікроконтролера Arduino, що знаходиться за течією, надійно опитувати свої порти вводу-виводу. Виявлена активність руху буде записана на SD-карту у форматі * .csv * із позначкою часу від годинника реального часу, а сценарії Python дозволяють аналізувати та генерувати актограми

Принципова схема та складання екрану детектора руху. a Принципова схема екрану детектора руху (MDS). MDS укладається в Щит реєстратора даних, і в кінцевому підсумку обидва підключаються до Arduino Uno Rev3. c Вид зверху MDS. d Вигляд знизу MDS. e Заміна бортового потенціометра на пару резисторів SMD0805. f Детальний зображення розміщення резистора SMD0805

Таблиця 1

Список матеріалів для екрану датчика руху

Посилання Кол.

AD1, AD2, AD3	3	3-полюсний, 2,54 мм, жатка	M20-9990346	Гарвін	745-7068
C1, C2, C3, C4,	6	електролітичний конденсатор	ECE-A1EKA220	Panasonic	807-3554
С5, С6	22 мкФ, 25 В
D1, D2, D3,	6	1N4148, 100 В, 300 мА	1N4148	Fairchild Semi	843-1562
D4, D5, D6
D7, D8, D9, D10,	6	Світлодіод, 3 мм, 1,85 В, червоний	L-7104SRC-D	Кінгбрайт	619-4886
D11, D12
IC1, IC2, IC3	3	SN74LS423N	SN74LS423N	Texas Instr.	809-5661
P1, P2, P3, P4,	6	4-полюсна, 2,54 мм, гніздо	М20-7820446	Гарвін	681-6814
Р5, Р6
Q1	1	Датчик світла TEMT6000	TEMT6000X01	Вішай	768-9354
R1, R14, R15,	8	10 кОм, SMD 0805	CRG0805F10K	TE Connect.	223-0562
R16, R17, R18,
R19, R20
R2, R3, R8, R9,	6	2,2 кОм, SMD 0805	CRG0805F2K2	TE Connect.	223-0477
R10, R13
R4, R5, R6, R7,	6	220 кОм, SMD 0805	CRG0805F220K	TE Connect.	223-0742
R11, R12
-	6	X-Band детектор руху	32213	Parallax Inc.	781-3074
SimplyTronics
-	6	4-полюсна, жіноча, 2,54 мм	5-103960-3	TE Connect.	842-8021
-	6	4-полюсний, чоловічий, 2,54 мм	5-103944-3	TE Connect.	842-8093
-	1	PTFE кабель	-	RS Pro	877-5443
-	2	Arduino Stackable	PRT-11417	Sparkfun	-
Комплект жаток - R3
-	1	Щит реєстратора даних	1141	Адафрут	-
-	1	Arduino Uno Rev3	A000073	Ардуїно	769-7409
RI	6	10 Ом, SMD 0805	CRG0805F10R	TE Connect.	223-0152
RII	6	51 кОм, SMD 0805	CRCW080551K0FKEA	Вішай	679-1525
-	1	Блок живлення постійного струму	8154014	RS Pro	737-8149