Виснаження високомолекулярних білків для ідентифікації дрібних білків і коротких відкритих
Історія публікацій
Перегляди статей
Альтметричний
Цитати
Перегляди статей - це сумісна з COUNTER сума повнотекстових завантажень статей з листопада 2008 року (як PDF, так і HTML) для всіх установ та приватних осіб. Ці показники регулярно оновлюються з урахуванням використання до останніх кількох днів.
Цитати - це кількість інших статей, що цитують цю статтю, розрахована Crossref і оновлюється щодня. Знайдіть більше інформації про кількість посилань Crossref.
Альтметричний показник уваги - це кількісний показник уваги, яку дослідницька стаття приділяла Інтернету. Клацнувши на піктограму пампушки, ви завантажите сторінку на altmetric.com із додатковими відомостями про оцінку та присутність у соціальних мережах для даної статті. Знайдіть більше інформації про показник висоти уваги та про те, як обчислюється рахунок.
Анотація
Ідентифікація малих білків та пептидів (нижче приблизно 100–150 амінокислот) у складних біологічних зразках ускладнюється домінуванням білків з більшою молекулярною масою. Навпаки, збільшення знань про альтернативні або короткі відкриті рамки зчитування створює потребу в методах, які дозволяють підтвердити існування відповідних генних продуктів у експериментах з протеоміки. Ми представляємо методологію осадження на основі ацетонітрилу, яка виснажує більшість білків вище приблизно. 15 кДа. Такі параметри, як склад виснажувальної суміші, рН та температура, були оптимізовані за допомогою модельної білкової суміші, і метод оцінювали у порівнянні із встановленим методом диференціальної розчинності. Цей підхід був застосований до аналізу низькомолекулярного протеома архей Methanosarcina mazei за допомогою LC – MS. Дані чітко демонструють сприятливий ефект від зменшення складності, особливо з точки зору якості ідентифікації малих білків на основі РС/МС. Цей швидкий метод, що не містить миючих засобів, дозволив, з мінімальним маніпулюванням зразком, успішну ідентифікацію кількох ще не ідентифікованих коротких відкритих рамок зчитування, кодованих в М. мазей.