Публікації; ZarLab

Наша група публікує статті, що представляють нові методології, описують результати досліджень, що використовують наше програмне забезпечення, та оглядають актуальні теми в галузі біоінформатики. Прокрутіть униз або клацніть тут, щоб отримати повний перелік робіт, вироблених нашою лабораторією. З 2013 року ми пишемо публікації в блогах, у яких підсумовуємо нові наукові статті та оглядові статті:

ЛаП'єр, Натан; Мангул, Сергей; Альсер, Мохаммед; Мандріч, Ігор; Ву, Микола С; Кослицький, Давид; Ескін, Елеазар

BMC Genomics, 20 (Suppl 5), pp. 423, 2019, ISSN: 1471-2164 .

Мангул, Сергей; Мартін, Лана С; Ескін, Елеазар; Блехман, Ран

Геном Біол, 20 (1), с.47, 2019, ISSN: 1474-760X .

Дуонг, Дат; Ахмад, Васі Уддін; Ескін, Елеазар; Чанг, Кай-Вей З; Лі, Jingyi Jessica

J Comput Biol, 26 (1), pp. 38-52, 2019, ISSN: 1557-8666 .

Мангул, Сергей; Мартін, Лана С; Ленгмід, Бен; Санчес-Галан, Хав'єр Е; Тома, Ян; Хормоздіарі, Ферейдун; Певзнер, Павло; Ескін, Елеазар

Nat Biotechnol, 37 (3), pp. 324-326, 2019, ISSN: 1546-1696 .

Мангул, Сергей; Мартін, Лана С; Хілл, Брайан Л; Лам, Анжела Ка-Мей; Діслер, Маргарет Дж; Зеліковський, Олексій; Ескін, Елеазар; Флінт, Джонатан

Nat Commun, 10 (1), pp. 1393, 2019, ISSN: 2041-1723 .

Мангул, Сергей; Мечеть, Тіаго; Абділл, Річард Дж .; Дуонг, Дат; Мітчелл, Кіт; Сарвал, Варуні; Хілл, Брайан; Бріто, Жаклін; Літтман, Рассел Джаред; Статц, Бенджамін; Лам, Анжела Ка-Мей; Дайяма, Гаргі; Грінейзен, Лора; Мартін, Лана С; Флінт, Джонатан; Ескін, Елеазар; Блехман, Ран

PLoS Biol, 17 (6), стор. E3000333, 2019, ISSN: 1545-7885 .

Гай, Ліза; Ескін, Елеазар

Біоінформатика, 34 (13), с. I467-i474, 2018, ISSN: 1367-4811 .

Хормоздіарі, Фархад I; Юнг, Джунгюн; Ескін, Елеазар; Джо, Чжон Ва Дж

bioRxiv, с. 498360, 2018 .

Кеннеді, Елізабет М; Герінг, Джордж Н; Ніколс, Майкл Н; Робінс, Хлоя; Мехта, Дів'я; Кленгель, Торстен; Ескін, Елеазар; Сміт, Алісія К; Коннелі, Карен Н.

BMC Genomics, 19 (1), с.476, 2018, ISSN: 1471-2164 .

13udotk генів, щоб дослідити, як метилювання ДНК взаємодіє з експресією генів у всьому геномі. РЕЗУЛЬТАТИ: Ми використовували лінійну змішану модель для оцінки кореляції метилювання ДНК при

400udotk CpGs із змінами експресії генів при

Стенограми 13udotk у двох незалежних наборах даних з клітин крові людини. Серед CpG, при яких метилювання суттєво асоціюється з транскрипцією (eCpG),> 50% є дистальними (> 50udotkb) або транс (різними хромосомами) до корельованого гена. Багато пар eCpG-транскриптів узгоджуються між дослідженнями та

90% сусідніх eCpG в рамках досліджень асоціюються з тим самим геном. Ми виявили, що енхансери (P 50% дистальні (> 50udotkb) або транс (різні хромосоми) до корельованого гена. Багато пар eCpG-транскриптів узгоджуються між дослідженнями та

90% сусідніх eCpG в рамках досліджень асоціюються з тим самим геном. Ми виявляємо, що підсилювачі (стаття P Journal

Генетика, 2018, ISSN: 1943-2631 .

Мангул, Сергей; Ян, Гаррі Тегюн; Штраулі, Ніколас; Груль, Франциска; Порат, Хагіт Т; Сі, Кевін; Чен, Лінус; Дейлі, Тімоті; Крістенсон, Стефані; Весоловська-Андерсен, Агата; Спреафіко, Роберто; Ріос, Сідней; Інж, Селеста; Сміт, Ендрю Д. Ернандес, Райан Д; Опхофф, Роел А; Сантана, Хосе Родрігес; Леванон, Ерез Ю; Вудрафф, Прескотт G; Берчард, Естебан; Сейболд, Макс А; Шифман, Сагів; Ескін, Елеазар; Зайтлен, Ной

Геном Біол, 19 (1), с.36, 2018, ISSN: 1474-760X .

Рахмані, Еліор; Швайгер, Регев; Шенгав, Ліат; Вінгерт, Теодора; Хофер, Іра; Габель, Ейлон; Ескін, Елеазар; Гальперін, Еран

Геном Біол, 19 (1), с.141, 2018, ISSN: 1474-760X .

Ву, Юе; Хормоздіарі, Фархад; Чжу, Чжон Ва Дж; Ескін, Елеазар

J Comput Biol, 2018, ISSN: 1557-8666 .

Мангул, Сергей; Мартін, Лана С; Ескін, Елеазар

Nat Biotechnol, 36 (4), pp. 369-371, 2018, ISSN: 1546-1696 .

Гамазон, Ерік Р; Сегре, Айелле V; ван де Бун, Мартін; Вень, Сяоцюань; Сі, Хуалін S; Хормоздіарі, Фархад; Онген, Халіт; Конкашбаєв, Ануар; Деркс, Еске М; Агет, Франсуа; Куань, Цзе; Ніколае, Ден Л; Ескін, Елеазар; Келліс, Маноліс; Гец, Гад; Маккарті, Марк I; Дерміцакіс, Еммануїл Т; Кокс, Ненсі Дж .; Ардлі, Крістін Г.

Nat Genet, 50 (7), pp. 956-967, 2018, ISSN: 1546-1718 .

Хормоздіарі, Фархад; Газал, Стівен; ван де Гейн, Брайс; Фінукан, Гіларі К; Джу, Челсі J-T; Лох, По-Ру Р; Шоч, Армін; Решеф, Якір; Лю, Сюаньяо; О'Коннор, Люк; Гусєв, Олександр; Ескін, Елеазар; Ціна, Алкес Л

Nat Genet, 50 (7), pp. 1041-1047, 2018, ISSN: 1546-1718 .

Сул, Дже Хун; Мартін, Лана С; Ескін, Елеазар

PLoS Genet, 14 (12), стор. E1007309, 2018, ISSN: 1553-7404 .

Loohuis, Loes Olde M; Мангул, Сергей; Орі, Аніл P S; Жоспен, Гійом; Кослицький, Давид; Ян, Гаррі Тегюн; Ву, Тимофій; Бокс, Марко П; Ломен-Горт, Кетрін; Відо-Пазос, Мартіна; Кантор, Ріта М; де Вос, Віллем М; Кан, Рене С; Ескін, Елеазар; Ophoff, Roel A

Transl Psychiatry, 8 (1), pp. 96, 2018, ISSN: 2158-3188 .

Роберт Браун Гліб Кічаєв, Ніколас Манкузо Джеймс Букок; Пасанюк, Богдан

Біоінформатика, стор. Btx142, 2017 .

Річі, Мерілін Д; Девіс, Джо Р; Ашард, Хьюг; Бій, Олексій; Конті, Девід; Ду, Менгменг; Ескін, Елеазар; Фоллін, Даніеле М; Хсу, Лі; Крафт, Пітер; Мур, Джейсон Х; Пірс, Брендон Л; Бієн, Стефанія А; Томас, Дункан С; Вей, Пен; Монтгомері, Стівен Б

---