Регенерований скелетний м’яз миші mdx демонструє диференційовану експресію мРНК Journal of Applied

Відділ дитячої неврології, Департамент неврології, Каліфорнійський університет у Сан-Франциско, Сан-Франциско, Каліфорнія 94143;

Дослідницький центр генетичної медицини, Дитячий національний медичний центр, Вашингтон, округ Колумбія, 20010; Відділи

Ветеринарні біомедичні науки,

Відділ біологічних наук, Державний університет Нью-Йорка в Баффало, Баффало, Нью-Йорк 14260-1300

Ветеринарна патобіологія, Університет Міссурі, Колумбія, Колумбія, Міссурі, 65211; і

Ветеринарні біомедичні науки,

Анотація

Незважаючи на понад 3000 статей, опублікованих про дистрофін за останні 15 років, причини, що лежать в основі прогресування захворювання людини, диференціальної участі м’язів та різнорідних фенотипів у різних видів, не зрозумілі. У цьому експерименті використано екран з 12 488 мРНК у 16-тижневої миші mdx м’язи в той час, коли скелетний м’яз уникає важкої дистрофічної патофізіології, незважаючи на відсутність функціонального білка дистрофіну. Ряд стенограм, рівні яких відрізнялись між mdx та м’язової дистрофії Дюшенна у людини. Зниження мРНК міостатину в mdx м'яз не відзначався. Диференціальна регуляція актинового білка 2/3 (субодиниця 4), β-тимозину, кальпоніну, хімази тучних клітин та мРНК гуанідиноацетату метилтрансферази у більш доброякісних mdx також спостерігався. Розшифровки окисних та гліколітичних ферментів у Росії mdx м'язи не регулювались. Ці розбіжності можуть забезпечити кандидатів на шляхи порятунку, які підтримують цілісність скелетних м'язів за відсутності функціонального білка дистрофіну в mdx скелетних м’язів.

Тварини.

Звичайний [C57Bl10 (чорний 10)] та mdx [C57Bl10 (чорний 10)mdx/mdx] миші були виведені доктором Джозефом А. Гранчеллі (Університет Нью-Йорка в Баффало, Нью-Йорк) з оригінальних селекційних пар, поставлених лабораторією Джексона (Бар-Харбор, Массачусетс).

Обробка РНК.

Аналіз масиву GeneChip.

З кожного масиву було зроблено два скани: сканування антикон’югатного антитіла (S1) та сканування після ампліфікації біотину, стрептавідину та фікоеритрину (S2). Якщо набори зондів вважали «насиченими» на S2, тоді для цього набору зондів використовувались нормовані (післямасштабні) середні значення різниці S1. Ми вважали зонд, призначений для демонстрації доказів насичення семи генів, коли порівняльний аналіз S1 проти S2 для того самого GeneChip показав значну різницю між середніми значеннями різниці (наприклад, нормалізоване середнє значення різниці не відтворювалось між S1 та S2 для той самий набір зондів). Нарешті, усі залишки дзвінків із коефіцієнтом помилкового виявлення (FDR)

Таблиця 1. МРНК, диференційовано виражені в 16-тижневому mdx шлунково-м’язовому м’язі порівняно з контролем, відповідним за віком

Зміни складки відносно контролю, де контроль = 1,00, I, збільшення кратності; D, зменшення складок. Студентська т-показані результати тестів. Скориговано коефіцієнт помилкового виявлення (FDR) наводяться значення. MAC-1, мембранний атакуючий комплекс-1; EST, виражені теги послідовності; HSP, білок теплового шоку; TGF, тубулогломерулярний зворотний зв'язок; VCAM-1, молекула адгезії судинних клітин 1; ЛПНЩ, ліпопротеїни дуже низької щільності.