Специфічні для органу швидкості подовження трансляції, виміряні за допомогою біоRxiv профілювання рибосом in vivo

Анотація

Синтез і деградація білків - це складні біологічні процеси, що включають понад сотню білків, що діють вкрай традиційно. Незважаючи на прогрес, доступ до перекладу у живих тварин доступний небагато, оскільки збільшення складності тварин обмежує репертуар експериментальних інструментів, які можна застосовувати для спостереження та маніпулювання процесами в організмі тварини, органах та окремих клітинах. У цьому дослідженні ми розробили метод без маркування для вимірювання специфічних для органу та клітин типу швидкості подовження трансляції. Він базується на прийнятій у часі доставці інгібіторів ініціації трансляції та подовження у живих тварин з подальшим профілюванням рибосом. У ньому також повідомляється про місця ініціювання перекладу в певних органах. За допомогою цього методу ми виявили, що швидкість елонгації відрізняється між органами миші, і визначили, що вони становлять 6,8, 5,2 та 4,4 амінокислоти в секунду для печінки, нирок та скелетних м'язів відповідно.

---